RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ACKR4Q9NPB9 350 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 C20orf202A1L168 122 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 CBR3O75828 277 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ZGLP1P0C6A0 271 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 NDUFB7P17568 137 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 MPPED2Q15777 294 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 C4orf17Q53FE4 359 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 LYSMD2Q8IV50 215 aa7.19□□□□□ -1.26
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USP3-201ENST00000268049 MARC2Q969Z3 335 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 FGF22Q9HCT0 170 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 C5AR2Q9P296 337 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 CORINQ9Y5Q5 1042 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 H3BSH0 61 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 SIX6O95475 246 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 IGLV3-25P01717 112 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 DNAJB13P59910 316 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 MS4A2Q01362 244 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 LIMS2Q7Z4I7 341 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 TMEM135Q86UB9 458 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 KDM8Q8N371 416 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 MS4A15Q8N5U1 240 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ZNF439Q8NDP4 499 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ZFAND1Q8TCF1 268 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ASB11Q8WXH4 323 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 BOCQ9BWV1 1114 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 PIGMQ9H3S5 423 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 FAAHO00519 579 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 C1QBP02746 253 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 SLC35E2P0CK97 266 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 GGT1P19440 569 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 PCSK6P29122 969 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 MLLT10P55197 1068 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 SORDQ00796 357 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 LRRC10Q5BKY1 277 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 HUS1BQ8NHY5 278 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 RHEBL1Q8TAI7 183 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 GLYATL2Q8WU03 294 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 RTL8AQ9BWD3 113 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 NOX3Q9HBY0 568 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 LYRM4Q9HD34 91 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 TTC3P53804 2025 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 CTDSP2O14595 271 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ZNF264O43296 627 aa7.19□□□□□ -1.26
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USP3-201ENST00000268049 F2RL1P55085 397 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 PPP2CBP62714 309 aa7.19□□□□□ -1.26
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USP3-201ENST00000268049 PPP2CAP67775 309 aa7.19□□□□□ -1.26
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USP3-201ENST00000268049 MOB1BQ7L9L4 216 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 TEX26Q8N6G2 289 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 SLC30A7Q8NEW0 376 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 OR56B4Q8NH76 319 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 SLC35B4Q969S0 331 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 DIRC2Q96SL1 478 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 PIP5K1AQ99755 562 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 TTTY10Q9BZA0 68 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 BCO1Q9HAY6 547 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 RXFP3Q9NSD7 469 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 GIMAP2Q9UG22 337 aa7.19□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa7.19□□□□□ -1.26
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USP3-201ENST00000268049 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa7.18□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 SMLR1H3BR10 107 aa7.18□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
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USP3-201ENST00000268049 AMY2BP19961 511 aa7.18□□□□□ -1.26
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USP3-201ENST00000268049 S100A11P31949 105 aa7.18□□□□□ -1.26
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USP3-201ENST00000268049 ZNF684Q5T5D7 378 aa7.18□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 TMEM65Q6PI78 240 aa7.18□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 OR4K1Q8NGD4 311 aa7.18□□□□□ -1.26
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