RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 TGIF1Q15583 401 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 NDUFAF7Q7L592 441 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 NR2C2APQ86WQ0 139 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 SIAH3Q8IW03 269 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 ACOT12Q8WYK0 555 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF160Q9HCG1 818 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 FLRT3Q9NZU0 649 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 IL17BQ9UHF5 180 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 FAM74A7A6NL05 159 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 SYT5O00445 386 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 PEPDP12955 493 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 NID1P14543 1247 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 S100A12P80511 92 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 EXT1Q16394 746 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 FAM74A3Q4VXF1 159 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 DIO2Q92813 273 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 FGF11Q92914 225 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 FRS3O43559 492 aa18.41■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 ABCD3P28288 659 aa18.41■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 CDK5Q00535 292 aa18.41■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 PLCXD2Q0VAA5 305 aa18.41■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 RAB40BQ12829 278 aa18.41■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 PM20D2Q8IYS1 436 aa18.41■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 OR6T1Q8NGN1 323 aa18.41■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 OR4C3Q8NH37 302 aa18.41■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 FAM117AQ9C073 453 aa18.41■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa18.41■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 F8W036 122 aa18.41■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 ZFAND5O76080 213 aa18.41■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 EFNB1P98172 346 aa18.41■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF141Q15928 474 aa18.41■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 SLC25A30Q5SVS4 291 aa18.41■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 MRGPREQ86SM8 312 aa18.41■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF614Q8N883 585 aa18.41■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 ADOQ96SZ5 270 aa18.41■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 ARHGDIGQ99819 225 aa18.41■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 MMP25Q9NPA2 562 aa18.41■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 NPTNQ9Y639 398 aa18.41■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 AIPO00170 330 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 TSPAN2O60636 221 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 REM1O75628 298 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 TFP02787 698 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 MT-ND4P03905 459 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 HMGN1P05114 100 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 PLAURQ03405 335 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 OAFQ86UD1 273 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 OR5L2Q8NGL0 311 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 M1APQ8TC57 530 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 GPR160Q9UJ42 338 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 FBXL4Q9UKA2 621 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 SLC13A4Q9UKG4 626 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 MTNR1AP48039 350 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 DEFA5Q01523 94 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 RTP5Q14D33 572 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 CD300LDQ6UXZ3 194 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 P4HTMQ9NXG6 502 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 CLEC4AQ9UMR7 237 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 ANXA2P2A6NMY6 339 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 ABCD4O14678 606 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 IL12BP29460 328 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 EIPR1Q53HC9 387 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 C1orf94Q6P1W5 598 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 DEFB126Q9BYW3 111 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 MYOTQ9UBF9 498 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 EXPH5Q8NEV8 1989 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 CDHR4A6H8M9 788 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 PRODHO43272 600 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF254O75437 659 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 UTS2O95399 124 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 NTN1O95631 604 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 BTN2A1Q7KYR7 527 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF454Q8N9F8 522 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 YIPF5Q969M3 257 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 SELENOFO60613 162 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 ADAM11O75078 769 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 ICOSLGO75144 302 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 HPP00738 406 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 LIPCP11150 499 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 SLC1A3P43003 542 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 NRG3P56975 720 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 ZFP3Q96NJ6 502 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 KLHL28Q9NXS3 571 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 RASD1Q9Y272 281 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2B-201ENST00000265339 ARHGDIBP52566 201 aa18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms