RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 OR10J5Q8NHC4 309 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 GTF2H4Q92759 462 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM202A6NGA9 273 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 UBBP0CG47 229 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 RFC3P40938 356 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 CDK5R2Q13319 367 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 FCRLAQ7L513 359 aa9.7□□□□□ -0.86
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TRPS1-201ENST00000220888 TMEM104Q8NE00 496 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 FGGYQ96C11 551 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 SLC38A1Q9H2H9 487 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 POM121BA6NF01 834 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 TNFRSF10AO00220 468 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 SNNO75324 88 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 SNCGO76070 127 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 GOSR1O95249 250 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 FAM157BP0CG42 384 aa9.7□□□□□ -0.86
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TRPS1-201ENST00000220888 GABRG1Q8N1C3 465 aa9.7□□□□□ -0.86
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TRPS1-201ENST00000220888 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 KRBA1A5PL33 1030 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 AGAP14A8MT82 685 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 I6L893 689 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 K7EPK0 472 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 SULT1C2O00338 296 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 NSA2O95478 260 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
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TRPS1-201ENST00000220888 RNF4P78317 190 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 RAB35Q15286 201 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 C6orf89Q6UWU4 347 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa9.7□□□□□ -0.86
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TRPS1-201ENST00000220888 CHST8Q9H2A9 424 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 ARV1Q9H2C2 271 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 PEAK1Q9H792 1746 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
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TRPS1-201ENST00000220888 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
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TRPS1-201ENST00000220888 SLC38A5Q8WUX1 472 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM106AQ96A25 262 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 TM4SF18Q96CE8 201 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 MVB12AQ96EY5 273 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 ATOH8Q96SQ7 321 aa9.7□□□□□ -0.86
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TRPS1-201ENST00000220888 RNF32Q9H0A6 362 aa9.7□□□□□ -0.86
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TRPS1-201ENST00000220888 NUMA1Q14980 2115 aa9.7□□□□□ -0.86
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TRPS1-201ENST00000220888 A0A1W2PPZ6 126 aa9.69□□□□□ -0.86
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TRPS1-201ENST00000220888 METTL12A8MUP2 240 aa9.69□□□□□ -0.86
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TRPS1-201ENST00000220888 GPR12P47775 334 aa9.69□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF767PQ75MW2 155 aa9.69□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF740Q8NDX6 193 aa9.69□□□□□ -0.86
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TRPS1-201ENST00000220888 STACQ99469 402 aa9.69□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 GLIPR2Q9H4G4 154 aa9.69□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 NECAP2Q9NVZ3 263 aa9.69□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 H0YIG0 161 aa9.69□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 AQP7O14520 342 aa9.69□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 ARHGAP33O14559 1287 aa9.69□□□□□ -0.86
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TRPS1-201ENST00000220888 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 SLC19A1P41440 591 aa9.69□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 DPPA2Q7Z7J5 298 aa9.69□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF439Q8NDP4 499 aa9.69□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 OR5M9Q8NGP3 310 aa9.69□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 MED20Q9H944 212 aa9.69□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 COPS3Q9UNS2 423 aa9.69□□□□□ -0.86
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