RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp395E9Q5N9 508 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CatsperdE9Q9F6 805 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 FaimlJ3QPY3 178 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gosr2O35166 212 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Foxd2O35392 492 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mup3P04939 184 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Camk2aP11798 478 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dcaf7P61963 342 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Art5P70352 309 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lrrc28Q3TX51 367 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mettl7a2Q5I0W6 244 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rrm2bQ6PEE3 351 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc34a3Q80SU6 601 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Jazf1Q80ZQ5 243 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Timmdc1Q8BUY5 285 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prkd2Q8BZ03 875 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rab43Q8CG50 210 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr215Q8VF82 310 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gatad2bQ8VHR5 594 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ddit4lQ8VHZ5 193 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gdpd1Q9CRY7 314 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CrtapQ9CYD3 400 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 4930447A16RikQ9D5F6 132 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rpl22l1Q9D7S7 122 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pycr3Q9DCC4 274 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kiaa0141Q9DCV6 510 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr545Q9WU94 316 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm7929A0A286YDV3 213 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Glb1l3A2RSQ1 649 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm21977F6U3N7 213 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm8247F6VRJ8 213 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm8005F6YKY3 213 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm3015F6ZAP6 213 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm8212F6ZMY5 213 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm7954F7BAX1 213 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm8138F7BY56 213 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm8232F7CFJ3 213 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm17079F7D8Y4 213 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn1r120K7N6J6 305 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm8165L7N218 213 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm8122L7N2C7 213 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm17078M0QW51 211 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PpibP24369 216 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tnfrsf1bP25119 474 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Clec10aP49300 304 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc35f3Q1LZI2 421 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Timm8a2Q4FZG7 97 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Epha6Q62413 1035 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ifngr2Q63953 332 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 LcorQ6ZPI3 433 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Abhd13Q80UX8 337 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pck2Q8BH04 640 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nsun3Q8CCT7 348 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Klf11Q8K1S5 502 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 FggQ8VCM7 436 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr98Q8VFD9 309 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr351Q8VGK1 310 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr644Q8VH21 314 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prmt3Q922H1 532 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NansQ99J77 359 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 EcdQ9CS74 641 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Abcb10Q9JI39 715 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Klhl1Q9JI74 751 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Oasl2Q9Z2F2 508 aa16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pcdhgb8A0A140LI48 931 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ceacam16E9QA28 426 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 P2rx1P51576 399 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ackr3P56485 362 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rack1P68040 317 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ankub1Q3UUE9 192 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 HhipQ7TN16 700 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 P4htmQ8BG58 503 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rxfp3Q8BGE9 472 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cadm4Q8R464 388 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rprd1bQ9CSU0 326 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Snapc3Q9D2C9 407 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Keg1Q9DCY0 295 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mrps34Q9JIK9 218 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sectm1bQ9JL59 212 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pramef6A2A8M8 474 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Morn1A2RTS7 477 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wdr25E9Q349 535 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nr1h5E9Q5A6 505 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Chrnb1P09690 501 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pcbp4P57724 403 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Epha4Q03137 986 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CbfbQ08024 187 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccdc69Q3TCJ8 202 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Osgin2Q3TEE9 550 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gtpbp2Q3UJK4 602 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mtmr11Q3V1L6 700 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cachd1Q6PDJ1 1288 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gadl1Q80WP8 550 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 9130023H24RikQ8BG98 337 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mrps23Q8VE22 177 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Adck1Q9D0L4 525 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PlgrktQ9D3P8 147 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Alg5Q9DB25 324 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 RhouQ9EQT3 261 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Arl6ip1Q9JKW0 203 aa16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.5 ms