RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638481.1

SPIN3-208, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,050 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-208	ENST00000638481	TBX5	Q99593	518 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	MED20	Q9H944	212 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ICMT	O60725	284 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	NUDT14	O95848	222 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	HP	P00738	406 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	THBS2	P35442	1172 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC6A8	P48029	635 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	GHDC	Q8N2G8	530 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	RNF138	Q8WVD3	245 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	IFT27	Q9BW83	186 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ABCG5	Q9H222	651 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	IL17B	Q9UHF5	180 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	RASD1	Q9Y272	281 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	CACNG2	Q9Y698	323 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	DVL2	O14641	736 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	WISP1	O95388	367 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	AHCY	P23526	432 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	P2RX1	P51575	399 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	FXYD6P3	P58550	94 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ACTC1	P68032	377 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ACTA1	P68133	377 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ABHD4	Q8TB40	342 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	NKD1	Q969G9	470 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	TIMP4	Q99727	224 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	MED28	Q9H204	178 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	HSPB11	Q9Y547	144 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	AKAP13	Q12802	2813 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	SHOX	O15266	292 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	PAH	P00439	452 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	M6PR	P20645	277 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	PTGDS	P41222	190 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	FOXK2	Q01167	660 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	CBFB	Q13951	182 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ESCO2	Q56NI9	601 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	MISP	Q8IVT2	679 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	TEX19	Q8NA77	164 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ELOA3	Q8NG57	546 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	GPR137	Q96N19	417 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ING4	Q9UNL4	249 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	PGC	P20142	388 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	TACR3	P29371	465 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC3A1	Q07837	685 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	POU4F2	Q12837	409 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	TGIF1	Q15583	401 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	PXK	Q7Z7A4	578 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	GPR119	Q8TDV5	335 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	TEAD3	Q99594	435 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	EMC7	Q9NPA0	242 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	AUP1	Q9Y679	476 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	FREM3	P0C091	2139 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	MED12	Q93074	2177 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	C7orf66	A4D0T2	115 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	LEUTX	A8MZ59	168 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	LRRN3	E7EW58	273 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	LANCL1	O43813	399 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25

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