RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617875.4

RECQL4-209, Transcript of RecQ like helicase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RECQL4, Length 3,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4-209ENST00000617875 MAMSTRQ6ZN01 415 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 RHOUQ7L0Q8 258 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 INTS14Q96SY0 518 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 ABRACLQ9P1F3 81 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 SCML1Q9UN30 329 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 PATJQ8NI35 1801 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 SHISA8B8ZZ34 492 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 ACOT7O00154 380 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 ZFPL1O95159 310 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 ZGLP1P0C6A0 271 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 OR2T7P0C7T2 308 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 ZNF20P17024 532 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 ENPP1P22413 925 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 S100A11P31949 105 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 FRKP42685 505 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 LIMS1P48059 325 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 LUMP51884 338 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 CXADRP78310 365 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 FAM53BQ14153 422 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 TMEM225Q6GV28 225 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 TPRA1Q86W33 373 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 OR2T27Q8NH04 317 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 GPR148Q8TDV2 347 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 COX14Q96I36 57 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 MED18Q9BUE0 208 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 TMEM231Q9H6L2 316 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 KCNG2Q9UJ96 466 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 CAMK2AQ9UQM7 478 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 ARRDC5A6NEK1 342 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 ZNF878C9JN71 531 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 LCN10Q6JVE6 187 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 COX15Q7KZN9 410 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 YIPF5Q969M3 257 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 A0A087WV48 116 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 F8W036 122 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 BLOC1S1P78537 153 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 DUSP8Q13202 625 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 RAB11BQ15907 218 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 DUSP6Q16828 381 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 ZNF584Q8IVC4 421 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 CCDC36Q8IYA8 594 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 SPAG16Q8N0X2 631 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 C2CD4CQ8TF44 421 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 EMC9Q9Y3B6 208 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 TSPAN11A1L157 253 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 PI3P19957 117 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 CCNOP22674 350 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 CBFBQ13951 182 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 CCDC107Q8WV48 283 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 OR2A5Q96R48 311 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 FLRT3Q9NZU0 649 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 MPIG6BO95866 241 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 POU3F4P49335 361 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 POU4F2Q12837 409 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 TSSK4Q6SA08 328 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 MDGA2Q7Z553 956 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 NEK7Q8TDX7 302 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 FBXW5Q969U6 566 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 MBD2Q9UBB5 411 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 UPB1Q9UBR1 384 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 ZNF337Q9Y3M9 751 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 SERTM1A2A2V5 107 aa14.6□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 KNG1P01042 644 aa14.6□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 RIDAP52758 137 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 CDK5R1Q15078 307 aa14.6□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 GSG1Q2KHT4 349 aa14.6□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 IQCF2Q8IXL9 164 aa14.6□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 MOGAT1Q96PD6 335 aa14.6□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 ARHGDIGQ99819 225 aa14.6□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 MED17Q9NVC6 651 aa14.6□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 PRODH2Q9UF12 536 aa14.6□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 FADS1O60427 444 aa14.6□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 CD34P28906 385 aa14.6□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 C21orf58P58505 322 aa14.6□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 RAP2BP61225 183 aa14.6□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 PHF19Q5T6S3 580 aa14.6□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 FAM69AQ5T7M9 428 aa14.6□□□□□ -0.07
RECQL4-209ENST00000617875 OR13C9Q8NGT0 318 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.9 ms