RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 CBLN3Q6UW01 205 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 CEACAM19Q7Z692 300 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2Y1Q8NGV0 311 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 HPS1Q92902 700 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 CMTM3Q96MX0 182 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 IP6K3Q96PC2 410 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 OR6C70A6NIJ9 312 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 NDUFB5O43674 189 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 HIST1H2ABP04908 130 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 MST1P26927 711 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 TACR3P29371 465 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 OTX2P32243 289 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 RFX2P48378 723 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 CCR4P51679 360 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 ERVK-25P63136 954 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF117Q03924 483 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 EGR4Q05215 589 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 ACSM3Q53FZ2 586 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 LINC01590Q5TEZ4 76 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC16A9Q7RTY1 509 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 NRARPQ7Z6K4 114 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 UBQLNLQ8IYU4 475 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 SNX33Q8WV41 574 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 HIST1H2ACQ93077 130 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 OMA1Q96E52 524 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 PELI1Q96FA3 418 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 GAL3ST4Q96RP7 486 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 NMNAT3Q96T66 252 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 CYSLTR2Q9NS75 346 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 OR6C68A6NDL8 312 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 HPGDSO60760 199 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 GYPBP06028 91 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXL2P58012 376 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 CBFBQ13951 182 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 GATSQ8NAP1 163 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5J2Q8NH18 312 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 MOSPD2Q8NHP6 518 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 GHSRQ92847 366 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 ABRACLQ9P1F3 81 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 A6NL46 340 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 TTLL8A6PVC2 850 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 UMODP07911 640 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 TACSTD2P09758 323 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 GP1BBP13224 206 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 CXCR1P25024 350 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 AQP2P41181 271 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 FOLR3P41439 243 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 CASP3P42574 277 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 HTR3AP46098 478 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 P2RX1P51575 399 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 CAV3P56539 151 aa22.93■■□□□ 1.26
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CAPNS1-204ENST00000587718 CTXN1P60606 82 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC3A1Q07837 685 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 VWA2Q5GFL6 755 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIQKQ629K1 86 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 MZT2BQ6NZ67 158 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 OVCH1Q7RTY7 1134 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 RDH10Q8IZV5 341 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2T4Q8NH00 348 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 MKL2Q9ULH7 1088 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRN3E7EW58 273 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 FADS1O60427 444 aa22.92■■□□□ 1.26
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CAPNS1-204ENST00000587718 IMPDH2P12268 514 aa22.92■■□□□ 1.26
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CAPNS1-204ENST00000587718 SHC1P29353 583 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 TALDO1P37837 337 aa22.92■■□□□ 1.26
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CAPNS1-204ENST00000587718 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
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CAPNS1-204ENST00000587718 SELENBP1Q13228 472 aa22.92■■□□□ 1.26
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CAPNS1-204ENST00000587718 SFXN4Q6P4A7 337 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 LEG1Q6P5S2 330 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 COX15Q7KZN9 410 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 SSX6Q7RTT6 188 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 C10orf53Q8N6V4 93 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 C19orf18Q8NEA5 215 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 STK35Q8TDR2 534 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 LPAR4Q99677 370 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNJ15Q99712 375 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 ALG12Q9BV10 488 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 PTPN13Q12923 2485 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 PHYHO14832 338 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 HCRTR2O43614 444 aa22.91■■□□□ 1.26
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