RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289		Q8N402	240 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	EID2	Q8N6I1	236 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SYT14	Q8NB59	555 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	LIPH	Q8WWY8	451 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TM9SF4	Q92544	642 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SGTB	Q96EQ0	304 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR1F2P	Q96R84	312 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SLITRK2	Q9H156	845 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PDE7B	Q9NP56	450 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	F5	P12259	2224 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A087WUJ7	227 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A1B0GWA3	101 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A1W2PQ09	198 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MEIOC	A2RUB1	952 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TLCD2	A6NGC4	264 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	C4orf51	C9J302	202 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289		M0R129	80 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OGG1	O15527	345 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	LINC01565	O15544	149 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	P2RX6	O15547	441 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SULT1B1	O43704	296 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	LDB3	O75112	727 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	REM1	O75628	298 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	LYPD3	O95274	346 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	EML2	O95834	649 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CH25H	O95992	272 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CSTA	P01040	98 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RAF1	P04049	648 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CSF2	P04141	144 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	IFNA16	P05015	189 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	IGHV4-34	P06331	123 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PROS1	P07225	676 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	YES1	P07947	543 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FUT1	P19526	365 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	NPR2	P20594	1047 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	C4BPB	P20851	252 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TBXA2R	P21731	343 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TGFBR1	P36897	503 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CASP3	P42574	277 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PITPNB	P48739	271 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TGM4	P49221	684 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	DIO1	P49895	249 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	EMD	P50402	254 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CAPZA1	P52907	286 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC25A1	P53007	311 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	AP3S2	P59780	193 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SIRPA	P78324	504 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MXD1	Q05195	221 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	IL18	Q14116	193 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FZD2	Q14332	565 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GGTLC2	Q14390	218 aa		4.1	□□□□□ -1.75

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