RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 LIPEQ05469 1076 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 CHRNB3Q05901 458 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 RAB35Q15286 201 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF74Q16587 644 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 CLEC12BQ2HXU8 276 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 CYBRD1Q53TN4 286 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00114Q6XXX2 140 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 WDR88Q6ZMY6 472 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 PXKQ7Z7A4 578 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 SLC15A3Q8IY34 581 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 MICU2Q8IYU8 434 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC17Q8N6Y2 441 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 SLC38A2Q96QD8 506 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 OR2M2Q96R28 347 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 ULBP2Q9BZM5 246 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 CBLN4Q9NTU7 201 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 RIMS3Q9UJD0 308 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 NAV3Q8IVL0 2385 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa7.26□□□□□ -1.25
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PTPRM-214ENST00000583153 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 OVOL3O00110 214 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 DENRO43583 198 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 SSX4O60224 188 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFS7O75251 213 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF432O94892 652 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 OR5F1O95221 314 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF682O95780 498 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 BCL10O95999 233 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 CD8AP01732 235 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 CD79AP11912 226 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 PAX1P15863 534 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 FUT1P19526 365 aa7.26□□□□□ -1.25
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PTPRM-214ENST00000583153 SELENOWP63302 87 aa7.26□□□□□ -1.25
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PTPRM-214ENST00000583153 PHYHD1Q5SRE7 291 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF544Q6NX49 715 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 VHLLQ6RSH7 139 aa7.26□□□□□ -1.25
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PTPRM-214ENST00000583153 C20orf196Q8IYI0 205 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM123Q8N131 208 aa7.26□□□□□ -1.25
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PTPRM-214ENST00000583153 FBXO17Q96EF6 278 aa7.26□□□□□ -1.25
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PTPRM-214ENST00000583153 SGTBQ96EQ0 304 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 LRR1Q96L50 414 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 CACNG6Q9BXT2 260 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 SLC19A3Q9BZV2 496 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 PCDHAC1Q9H158 963 aa7.26□□□□□ -1.25
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PTPRM-214ENST00000583153 NDE1Q9NXR1 346 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 TAS2R5Q9NYW4 299 aa7.26□□□□□ -1.25
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PTPRM-214ENST00000583153 MED31Q9Y3C7 131 aa7.26□□□□□ -1.25
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PTPRM-214ENST00000583153 TLN2Q9Y4G6 2542 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTPRM-214ENST00000583153 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 MCIDASD6RGH6 385 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTPRM-214ENST00000583153 GMNNO75496 209 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTPRM-214ENST00000583153 LY6G6DO95868 133 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 MT-ND1P03886 318 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 F13BP05160 661 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 CBR1P16152 277 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 ARR3P36575 388 aa7.25□□□□□ -1.25
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