RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 MMP11P24347 488 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 RPS19P39019 145 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 SRP9P49458 86 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 MFSD12Q6NUT3 480 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 SECTM1Q8WVN6 248 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 EPHX3Q9H6B9 360 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 TUSC2O75896 110 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 AAED1Q7RTV5 226 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 ADIPOR2Q86V24 386 aa19.69■□□□□ 0.74
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PTPRM-211ENST00000580170 BAGE2Q86Y30 109 aa19.69■□□□□ 0.74
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PTPRM-211ENST00000580170 NANOGP1Q8N7R0 232 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 DMBX1Q8NFW5 382 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 SLC6A18Q96N87 628 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 P2RY12Q9H244 342 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 A0A087WUU8 490 aa19.69■□□□□ 0.74
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PTPRM-211ENST00000580170 RDH10Q8IZV5 341 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 HMX2A2RU54 273 aa19.68■□□□□ 0.74
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PTPRM-211ENST00000580170 SLC35E2P0CK97 266 aa19.68■□□□□ 0.74
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PTPRM-211ENST00000580170 TMUB2Q71RG4 321 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF511Q8NB15 262 aa19.68■□□□□ 0.74
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PTPRM-211ENST00000580170 FGGYQ96C11 551 aa19.68■□□□□ 0.74
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF728P0DKX0 622 aa19.68■□□□□ 0.74
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PTPRM-211ENST00000580170 BTF3L4Q96K17 158 aa19.68■□□□□ 0.74
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PTPRM-211ENST00000580170 SHEQ5VZ18 495 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 ADAM5Q6NVV9 412 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 C17orf112F2Z3M2 114 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 DDAH2O95865 285 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 EDN3P14138 238 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 ABOP16442 354 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 PTGER4P35408 488 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 TLE4Q04727 773 aa19.68■□□□□ 0.74
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PTPRM-211ENST00000580170 YIPF5Q969M3 257 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 ZIC5Q96T25 663 aa19.68■□□□□ 0.74
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PTPRM-211ENST00000580170 SYT9Q86SS6 491 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
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PTPRM-211ENST00000580170 UBQLN3Q9H347 655 aa19.67■□□□□ 0.74
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PTPRM-211ENST00000580170 OXA1LQ15070 435 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 SLC35D3Q5M8T2 416 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 PLPP7Q8NBV4 271 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 C12orf57Q99622 126 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 SEC22CQ9BRL7 303 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 PIGMQ9H3S5 423 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 POFUT1Q9H488 388 aa19.67■□□□□ 0.74
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PTPRM-211ENST00000580170 C17orf67Q0P5P2 114 aa19.67■□□□□ 0.74
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PTPRM-211ENST00000580170 CD300LGQ6UXG3 332 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 RNF32Q9H0A6 362 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 TEAD1P28347 426 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 MARCH3Q86UD3 253 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 RNF170Q96K19 258 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 SLC46A1Q96NT5 459 aa19.66■□□□□ 0.74
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PTPRM-211ENST00000580170 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa19.66■□□□□ 0.74
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