RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 RERGLQ9H628 205 aa26.11■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A1W2PPB8 328 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A1W2PRS3 328 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 GJE1A6NN92 205 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 KIR3DP1A8MWS1 328 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 GAAP10253 952 aa26.1■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TP53I3Q53FA7 332 aa26.1■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TOMM20Q15388 145 aa26.09■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-208ENST00000573600 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa26.09■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-208ENST00000573600 KLHL15Q96M94 604 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 B3GAT1Q9P2W7 334 aa26.09■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa26.09■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 TBC1D25Q3MII6 688 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPINK14Q6IE38 97 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 HDDC2Q7Z4H3 204 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 KCNE4Q8WWG9 221 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-208ENST00000573600 KCNK17Q96T54 332 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDADC1Q9BWV3 514 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 WDR76Q9H967 626 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC24A3Q9HC58 644 aa26.08■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-208ENST00000573600 DEPPQ9NTK1 212 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-208ENST00000573600 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa26.08■■□□□ 1.76
CTDNEP1-208ENST00000573600 TVP23AA6NH52 213 aa26.08■■□□□ 1.76
CTDNEP1-208ENST00000573600 AQP7P3A6NL99 342 aa26.08■■□□□ 1.76
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CTDNEP1-208ENST00000573600 OGG1O15527 345 aa26.06■■□□□ 1.76
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CTLA4P16410 223 aa26.06■■□□□ 1.76
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ARL9Q6T311 187 aa26.06■■□□□ 1.76
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CTDNEP1-208ENST00000573600 GALNT8Q9NY28 637 aa26.06■■□□□ 1.76
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CTDNEP1-208ENST00000573600 RASD1Q9Y272 281 aa26.06■■□□□ 1.76
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TACSTD2P09758 323 aa26.05■■□□□ 1.76
CTDNEP1-208ENST00000573600 RORCP51449 518 aa26.05■■□□□ 1.76
CTDNEP1-208ENST00000573600 SIRPAP78324 504 aa26.05■■□□□ 1.76
CTDNEP1-208ENST00000573600 GLO1Q04760 184 aa26.05■■□□□ 1.76
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR1C1Q15619 314 aa26.05■■□□□ 1.76
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CTDNEP1-208ENST00000573600 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
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