RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557092.5

NEDD1-209, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-209ENST00000557092 DSCR9P59020 149 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 ST3GAL3Q11203 375 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 SWI5Q1ZZU3 235 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 MST1LQ2TV78 715 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF627Q7L945 461 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF525Q8N782 197 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 NUP37Q8NFH4 326 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 PRRC1Q96M27 445 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 NOX3Q9HBY0 568 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 B3GNT2Q9NY97 397 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 ALPK2Q86TB3 2170 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 VSTM5A8MXK1 200 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 B9A039 149 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 INAFM1C9JVW0 142 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 NME4O00746 187 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 PIP5K1CO60331 668 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 PDE5AO76074 875 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 RAB36O95755 333 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 IGHG1P01857 330 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 TP53P04637 393 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 F13BP05160 661 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 YAP1P46937 504 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 SEC24CP53992 1094 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 CLRN1P58418 232 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 HGFACQ04756 655 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 ADIPOQQ15848 244 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 VTCN1Q7Z7D3 282 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 IL17RDQ8NFM7 739 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 INIPQ9NRY2 104 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 FKBP7Q9Y680 259 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 ZANQ9Y493 2812 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD1-209ENST00000557092 TLN2Q9Y4G6 2542 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 LY6HO94772 140 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 UBL3O95164 117 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 IGF2P01344 180 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 IFNW1P05000 195 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 PGA4P0DJD7 388 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 PGA3P0DJD8 388 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 THBS4P35443 961 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 AQP2P41181 271 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 GIPRP48546 466 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 GSK3BP49841 420 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 DAG1Q14118 895 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 KRT80Q6KB66 452 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 HACD2Q6Y1H2 254 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 HDDC2Q7Z4H3 204 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 FAM168AQ92567 244 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 FAM162AQ96A26 154 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 CMTM5Q96DZ9 223 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 MS4A3Q96HJ5 214 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 SORCS2Q96PQ0 1159 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF442Q9H7R0 627 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 RHCGQ9UBD6 479 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 A4GNTQ9UNA3 340 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 CR1P17927 2039 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 CSPG4Q6UVK1 2322 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 FN1P02751 2386 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 NDUFAB1O14561 156 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 DHHO43323 396 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 ENTPD5O75356 428 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 QDPRP09417 244 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 CSF3P09919 207 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 IFI30P13284 250 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 NPR2P20594 1047 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 DAP3P51398 398 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 RAB1AP62820 205 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 KRTAP1-1Q07627 177 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 EFNB3Q15768 340 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 IFI44LQ53G44 452 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 LRFN4Q6PJG9 635 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 FKBP9P1Q75LS8 142 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 SKA3Q8IX90 412 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 SLC22A24Q8N4F4 322 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 SYT14Q8NB59 555 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 NOXO1Q8NFA2 376 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 OR10H5Q8NGA6 315 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 MOSPD2Q8NHP6 518 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 ASB10Q8WXI3 467 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 HSH2DQ96JZ2 352 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF347Q96SE7 839 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 FNDC11Q9BVV2 318 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 TMEM38BQ9NVV0 291 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF224Q9NZL3 707 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 NAV3Q8IVL0 2385 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 HIVEP2P31629 2446 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 J3KTA2 159 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 hCG_2039718K7EN88 272 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 FARS2O95363 451 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 F12P00748 615 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 SERPINA1P01009 418 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD1-209ENST00000557092 PATE4P0C8F1 98 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms