RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555624.1

AL355922.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AL355922.1, Length 337 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AL355922.1-201ENST00000555624 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 UBA52P62987 128 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 SKP2Q13309 424 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 SERTAD2Q14140 314 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 PRPSAP1Q14558 356 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 CEBPEQ15744 281 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 NDUFA9Q16795 377 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 CYP51A1Q16850 503 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 DUOXA1Q1HG43 343 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 SOWAHAQ2M3V2 549 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 ZNF699Q32M78 642 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 ADPRMQ3LIE5 342 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 PIGGQ5H8A4 983 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 SPIN3Q5JUX0 258 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 GCNT6Q5T4J0 391 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 SAMD13Q5VXD3 122 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 PMS2CLQ68D20 193 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 NCR3LG1Q68D85 454 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 GLYATQ6IB77 296 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 FAM45BPQ6NSW5 357 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 ATRAIDQ6UW56 229 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 LANCL3Q6ZV70 420 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 SLC29A4Q7RTT9 530 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 TMEM144Q7Z5S9 345 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 SPRED1Q7Z699 444 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 CUZD1Q86UP6 607 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 LDLRAD3Q86YD5 345 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 FUNDC1Q8IVP5 155 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 AQP12AQ8IXF9 295 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 Q8N3U1 123 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 TMEM217Q8N7C4 229 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 SAMD12Q8N8I0 201 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 LRRC57Q8N9N7 239 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 DUSP18Q8NEJ0 188 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 ZNF555Q8NEP9 628 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 BEST4Q8NFU0 473 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 OR56A4Q8NGH8 313 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 OR5L1Q8NGL2 311 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 FAM45AQ8TCE6 357 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 MAPK15Q8TD08 544 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 TMEM170AQ8WVE7 144 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 ARNTL2Q8WYA1 636 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 PIGBQ92521 554 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 DNASE1L2Q92874 299 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 LGALS12Q96DT0 336 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 TECTBQ96PL2 329 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 KLHDC3Q9BQ90 382 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 HINT2Q9BX68 163 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 SUCNR1Q9BXA5 334 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 PORCNQ9H237 461 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 TMEM38AQ9H6F2 299 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 FN3KRPQ9HA64 309 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 MMP25Q9NPA2 562 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 ECHDC1Q9NTX5 307 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 FBXO4Q9UKT5 387 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 IKZF3Q9UKT9 509 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 TPRKBQ9Y3C4 175 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 RGPD1P0DJD0 1748 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 MYO3AQ8NEV4 1616 aa3.55□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 TANC1Q9C0D5 1861 aa3.54□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 FLT4P35916 1363 aa3.54□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 SCN11AQ9UI33 1791 aa3.54□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 A0A096LPI6 279 aa3.54□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 TRAV39A0A0B4J263 110 aa3.54□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa3.54□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 C7orf66A4D0T2 115 aa3.54□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 C4orf47A7E2U8 309 aa3.54□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 HSPB2A8KAH6 182 aa3.54□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa3.54□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 PROB1E7EW31 1015 aa3.54□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 F6UZH7 168 aa3.54□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 K7EQM0 130 aa3.54□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 SGK494L7N484 410 aa3.54□□□□□ -1.84
AL355922.1-201ENST00000555624 M0R296 226 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.4 ms