RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 CA7P43166 264 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 CSNK1A1P48729 337 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 MLLT10P55197 1068 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ISL1P61371 349 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 EFNB1P98172 346 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 IL5RAQ01344 420 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 POU4F2Q12837 409 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 C6orf52Q5T4I8 152 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 LCN1P1Q5VSP4 162 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ACSM5Q6NUN0 579 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 DOLPP1Q86YN1 238 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ZNF100Q8IYN0 542 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 GPR137CQ8N3F9 429 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 MARVELD2Q8N4S9 558 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 OR52E2Q8NGJ4 325 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 OR6N1Q8NGY5 312 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 OR4Q3Q8NH05 313 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ABHD3Q8WU67 409 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 DNAJA3Q96EY1 480 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 Q96M85 177 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 TTYH2Q9BSA4 534 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 SFXN3Q9BWM7 321 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 PIGMQ9H3S5 423 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 SCN3BQ9NY72 215 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 SEC14L4Q9UDX3 406 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 IL20RAQ9UHF4 553 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 FKBP7Q9Y680 259 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ZZEF1O43149 2961 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 ZNF814B7Z6K7 855 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 TRMUO75648 421 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 KRT33AO76009 404 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 TGM6O95932 706 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 STSP08842 583 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 PGA4P0DJD7 388 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 PGA3P0DJD8 388 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 HLA-DOBP13765 273 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 CTSSP25774 331 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 EPHA2P29317 976 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 AGTR1P30556 359 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 ZNF84P51523 738 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 TGFBR3Q03167 851 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 GLO1Q04760 184 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 C3AR1Q16581 482 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 HIST3H3Q16695 136 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 NRN1LQ496H8 165 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 KLHL22Q53GT1 634 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 TMEM236Q5W0B7 351 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 NIPAL3Q6P499 406 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 LEG1Q6P5S2 330 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 RPTNQ6XPR3 784 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 SSX8Q7RTT4 187 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 IGFN1Q86VF2 1251 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 TUSC5Q8IXB3 177 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 C20orf196Q8IYI0 205 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 TMEM123Q8N131 208 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 KDM8Q8N371 416 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 IQCF1Q8N6M8 205 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 TCEANCQ8N8B7 351 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 ZIC4Q8N9L1 334 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 SLC37A3Q8NCC5 494 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 NOXO1Q8NFA2 376 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 OR4K13Q8NH42 304 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 FBLIM1Q8WUP2 373 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 RND1Q92730 232 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 TMEM54Q969K7 222 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 RELTQ969Z4 430 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 LRRC46Q96FV0 321 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 OR2M2Q96R28 347 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 WACQ9BTA9 647 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 RACGAP1Q9H0H5 632 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 ENKD1Q9H0I2 346 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 MED29Q9NX70 200 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 GLTPQ9NZD2 209 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 UPB1Q9UBR1 384 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 TPRKBQ9Y3C4 175 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 FAM215AQ9Y5M1 114 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 POLEQ07864 2286 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-220ENST00000550700 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms