RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540501.1

STIP1-208, Transcript of stress induced phosphoprotein 1, humanhuman

TSL 3

Gene STIP1, Length 880 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STIP1-208ENST00000540501 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa22.77■■□□□ 1.24
STIP1-208ENST00000540501 RIIAD1A6NNX1 92 aa22.77■■□□□ 1.24
STIP1-208ENST00000540501 SLC16A6O15403 523 aa22.77■■□□□ 1.24
STIP1-208ENST00000540501 CLRN1P58418 232 aa22.77■■□□□ 1.24
STIP1-208ENST00000540501 CDC42P60953 191 aa22.77■■□□□ 1.24
STIP1-208ENST00000540501 SIRPAP78324 504 aa22.77■■□□□ 1.24
STIP1-208ENST00000540501 FOXF2Q12947 444 aa22.77■■□□□ 1.24
STIP1-208ENST00000540501 ITGADQ13349 1161 aa22.77■■□□□ 1.24
STIP1-208ENST00000540501 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
STIP1-208ENST00000540501 NAXEQ8NCW5 288 aa22.77■■□□□ 1.24
STIP1-208ENST00000540501 PLEKHA8Q96JA3 519 aa22.77■■□□□ 1.24
STIP1-208ENST00000540501 RBP7Q96R05 134 aa22.77■■□□□ 1.24
STIP1-208ENST00000540501 EMC6Q9BV81 110 aa22.77■■□□□ 1.24
STIP1-208ENST00000540501 CMC2Q9NRP2 79 aa22.77■■□□□ 1.24
STIP1-208ENST00000540501 FAM118AQ9NWS6 357 aa22.77■■□□□ 1.24
STIP1-208ENST00000540501 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
STIP1-208ENST00000540501 FREM1Q5H8C1 2179 aa22.77■■□□□ 1.24
STIP1-208ENST00000540501 ARHGEF9O43307 516 aa22.76■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 TRMUO75648 421 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 RENP00797 406 aa22.76■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 ZNF3P17036 446 aa22.76■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 CSNK1A1P48729 337 aa22.76■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 CAMK2DQ13557 499 aa22.76■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 KEAP1Q14145 624 aa22.76■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 ACSM5Q6NUN0 579 aa22.76■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 TMEM123Q8N131 208 aa22.76■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 OR6N1Q8NGY5 312 aa22.76■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 STARD4Q96DR4 205 aa22.76■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 KCNK17Q96T54 332 aa22.76■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa22.75■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 H0YAE9 185 aa22.75■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 M0R3G1 203 aa22.75■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 DLGAP1O14490 977 aa22.75■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 MSTNO14793 375 aa22.75■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 PGA4P0DJD7 388 aa22.75■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 PGA3P0DJD8 388 aa22.75■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 CHRNB4P30926 498 aa22.75■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 SELENOPP49908 381 aa22.75■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 SNAPC1Q16533 368 aa22.75■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 THEM4Q5T1C6 240 aa22.75■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 C12orf73Q69YU5 71 aa22.75■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 C20orf196Q8IYI0 205 aa22.75■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 DEPDC4Q8N2C3 294 aa22.75■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 GPR137CQ8N3F9 429 aa22.75■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 IQCF1Q8N6M8 205 aa22.75■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 NOXO1Q8NFA2 376 aa22.75■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 RASD2Q96D21 266 aa22.75■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 CCDC120Q96HB5 630 aa22.75■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 MBOAT4Q96T53 435 aa22.75■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 UPB1Q9UBR1 384 aa22.75■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 RNF6Q9Y252 685 aa22.75■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 GMPPBQ9Y5P6 360 aa22.75■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 PRSS37A4D1T9 235 aa22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 E9PQ18 207 aa22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 KRT33AO76009 404 aa22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 AGAP20933 346 aa22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 PAICSP22234 425 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 EPHA2P29317 976 aa22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 NTF4P34130 210 aa22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 GGT2P36268 569 aa22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 STK11Q15831 433 aa22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 MESTQ5EB52 335 aa22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 TMEM236Q5W0B7 351 aa22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 VWA1Q6PCB0 445 aa22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 BEND4Q6ZU67 534 aa22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 BTLAQ7Z6A9 289 aa22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 OR52E2Q8NGJ4 325 aa22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 OR4K13Q8NH42 304 aa22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 TMEM54Q969K7 222 aa22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 PITX2Q99697 317 aa22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 ADI1Q9BV57 179 aa22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 FN3KQ9H479 309 aa22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 C12orf49Q9H741 205 aa22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 ASB6Q9NWX5 421 aa22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 TVP23BQ9NYZ1 205 aa22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 GLTPQ9NZD2 209 aa22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 SURF4O15260 269 aa22.73■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 CGAP01215 116 aa22.73■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 CD47Q08722 323 aa22.73■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 IL18R1Q13478 541 aa22.73■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 HIST3H3Q16695 136 aa22.73■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 FBXW9Q5XUX1 488 aa22.73■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 DNM1P34Q6PK57 102 aa22.73■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 IZUMO2Q6UXV1 221 aa22.73■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 TFAP2EQ6VUC0 442 aa22.73■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 MRGPRGQ86SM5 289 aa22.73■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 APOL4Q9BPW4 351 aa22.73■■□□□ 1.23
STIP1-208ENST00000540501 IMPAD1Q9NX62 359 aa22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms