RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 WASP42768 502 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 RPS25P62851 125 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SHC2P98077 582 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 CDK5Q00535 292 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 EBPQ15125 230 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 AAK1Q2M2I8 961 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 LRRTM1Q86UE6 522 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 OR14A16Q8NHC5 309 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 HLA-CQ95604 372 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 MOGAT1Q96PD6 335 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SMIM14Q96QK8 99 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 OR2A14Q96R47 310 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SLC35A5Q9BS91 424 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ATG101Q9BSB4 218 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 THSD1Q9NS62 852 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SEMA4GQ9NTN9 838 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 A0A1B0GVT2 93 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF878C9JN71 531 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 GABARAPH6UMI1 98 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 AP4M1O00189 453 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 HCRTR2O43614 444 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SLC25A12O75746 678 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 PCDH8O95206 1070 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 CTSSP25774 331 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 TNFRSF4P43489 277 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 NRG3P56975 720 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF763Q0D2J5 394 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 OR5I1Q13606 314 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 P2RY14Q15391 338 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ALG10BQ5I7T1 473 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF550Q7Z398 422 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 LRRTM4Q86VH4 590 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 TMPRSS12Q86WS5 348 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF559Q9BR84 538 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 GPR61Q9BZJ8 451 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 PARD6AQ9NPB6 346 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ASB1Q9Y576 335 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SIAH2O43255 324 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 APOA2P02652 100 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 BCHEP06276 602 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 JMJD7P0C870 316 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 NDUFS1P28331 727 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 PYCR1P32322 319 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 PRRX1P54821 245 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ISL1P61371 349 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 TPBGQ13641 420 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 OR2A2Q6IF42 318 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 GPR135Q8IZ08 494 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 CARFQ8N187 725 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 OR2T4Q8NH00 348 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ASB16Q96NS5 453 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 TECTBQ96PL2 329 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 MARVELD1Q9BSK0 173 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 JAM3Q9BX67 310 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ENKD1Q9H0I2 346 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SLAMF8Q9P0V8 285 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SLC22A14Q9Y267 594 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 MEIKINA0A087WXM9 373 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 FAM74A7A6NL05 159 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 C1orf105O95561 183 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 AIFM1O95831 613 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 NUDT14O95848 222 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 DRD2P14416 443 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 NDUFV2P19404 249 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 OR8G1Q15617 311 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP5.59□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 FAM74A3Q4VXF1 159 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ALG10Q5BKT4 473 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ANKRD34AQ69YU3 496 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 FRMPD2BQ6IN97 320 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 OVCH1Q7RTY7 1134 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 VRK3Q8IV63 474 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 C7orf61Q8IZ16 206 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 OR13D1Q8NGV5 346 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 RXFP4Q8TDU9 374 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 GPX8Q8TED1 209 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 TREM2Q9NZC2 230 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 A0A1B0GTL3 188 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 A0A1W2PR64 198 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 A0A1W2PRV1 198 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 OR6C68A6NDL8 312 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 FZD7O75084 574 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 HLA-HP01893 362 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms