RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534610.5

ATG13-222, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 5

Gene ATG13, Length 1,655 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-222	ENST00000534610	SP1	P08047	785 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	IFNGR1	P15260	489 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	PYCR1	P32322	319 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	LCN6	P62502	163 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	TUBA1B	P68363	451 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	TPBG	Q13641	420 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	USP43	Q70EL4	1123 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	TUBA1A	Q71U36	451 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	SNX33	Q8WV41	574 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	HAS2	Q92819	552 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	KLHL15	Q96M94	604 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	SFXN2	Q96NB2	322 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	OXGR1	Q96P68	337 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	MNT	Q99583	582 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	RNF32	Q9H0A6	362 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	SSR3	Q9UNL2	185 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	RASD1	Q9Y272	281 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	ATM	Q13315	3056 aa		13.77	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		13.77	□□□□□ -0.2
ATG13-222	ENST00000534610	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	CENPBD1	B2RD01	187 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	DNPH1	O43598	174 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	VAMP5	O95183	116 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	HLA-DOB	P13765	273 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF43	P17038	809 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	SERPINB10	P48595	397 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	CCL11	P51671	97 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	TAS2R43	P59537	309 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	ARG2	P78540	354 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	PLGLB1	Q02325	96 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	MELK	Q14680	651 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	SPCS2	Q15005	226 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	DGUOK	Q16854	277 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	SULF2	Q8IWU5	870 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	PHC2	Q8IXK0	858 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	OR6V1	Q8N148	313 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	EXD3	Q8N9H8	876 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	ASB10	Q8WXI3	467 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	TSSK2	Q96PF2	358 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	RBP7	Q96R05	134 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF649	Q9BS31	505 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	NUAK2	Q9H093	628 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	OR51E2	Q9H255	320 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	STUB1	Q9UNE7	303 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	B9D1	Q9UPM9	204 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	CACNA1G	O43497	2377 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	AQP7P3	A6NL99	342 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610		J3QLW9	94 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	SLC16A7	O60669	478 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	HLA-DQA2	P01906	255 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF19	P17023	458 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	UGT2B10	P36537	528 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	CLN3	Q13286	438 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	AQP6	Q13520	282 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	GPR50	Q13585	617 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	SSX1	Q16384	188 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	GPAT4	Q86UL3	456 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	ATCAY	Q86WG3	371 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	KLB	Q86Z14	1044 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	MPDZ	O75970	2070 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF726	A6NNF4	738 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	NME2P1	O60361	137 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	SELENOF	O60613	162 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	NME2	P22392	152 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	PAX7	P23759	505 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	SHC1	P29353	583 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	BID	P55957	195 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	NCS1	P62166	190 aa		13.75	□□□□□ -0.21

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