RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RUNDC3AQ59EK9 446 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM255AQ5JRV8 349 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 THEM4Q5T1C6 240 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1orf140Q5VVS0 124 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LIPMQ5VYY2 423 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLEC6AQ6EIG7 209 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SKA3Q8IX90 412 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCNYL1Q8N7R7 359 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 XAGE5Q8WWM1 108 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GATAD2BQ8WXI9 593 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5P2Q8WZ92 322 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCT7Q99832 543 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FOXB1Q99853 325 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1orf109Q9NX04 203 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRCH1Q9Y2L9 728 aa8.48□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCE6AA0A183 80 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CFAP73A6NFT4 308 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DUXAA6NLW8 204 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A8MVM7 634 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AK1P00568 194 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TFPTP0C1Z6 253 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR12D1P0DN82 309 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD33P20138 364 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CBLP22681 906 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UQCRC2P22695 453 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPS5P46782 204 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAP2K6P52564 334 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BPIFB3P59826 476 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP10-11P60412 298 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GALNTL6Q49A17 601 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C6orf120Q7Z4R8 191 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLBQ86Z14 1044 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C20orf196Q8IYI0 205 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM123Q8N131 208 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FITM2Q8N6M3 262 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCCPDHQ8NBX0 429 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OXGR1Q96P68 337 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TBX15Q96SF7 602 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARHGDIGQ99819 225 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SH3GL3Q99963 347 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RHOXF2Q9BQY4 288 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BCL2L14Q9BZR8 327 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR51I1Q9H343 314 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CNTD2Q9H8S5 307 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EXD2Q9NVH0 621 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIF17Q9P2E2 1029 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 B3GAT1Q9P2W7 334 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNX12Q9UMY4 172 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FIS1Q9Y3D6 152 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCL27Q9Y4X3 112 aa8.47□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.46□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MGRN1O60291 552 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AHSA1O95433 338 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GKN3PP0CG01 181 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VSIG10L2P0DP72 767 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UQCRBP14927 111 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HPCAL1P37235 193 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MDH2P40926 338 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAGEA12P43365 314 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLTPP55058 493 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TBC1D28Q2M2D7 210 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMU1Q2TAY7 513 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPAT3Q53EU6 434 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF774Q6NX45 483 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC27A4Q6P1M0 643 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FRRS1Q6ZNA5 592 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC35F6Q8N357 371 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLHDC1Q8N7A1 406 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR6N1Q8NGY5 312 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2T11Q8NH01 316 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SFXN5Q8TD22 340 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CFHR4Q92496 578 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LHX4Q969G2 390 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ROPN1LQ96C74 230 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC35G5Q96KT7 338 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDADC1Q9BWV3 514 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ULBP2Q9BZM5 246 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIM15Q9C019 465 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPA2Q9H2U2 334 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DPAGT1Q9H3H5 408 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GSTO2Q9H4Y5 243 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM216Q9P0N5 145 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FBXL3Q9UKT7 428 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR45Q9Y5Y3 372 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 USH1CQ9Y6N9 552 aa8.46□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa8.45□□□□□ -1.06
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