RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 H3BN98 237 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRK-218ENST00000525459 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRK-218ENST00000525459 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
PTPRK-218ENST00000525459 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
PTPRK-218ENST00000525459 NOS3P29474 1203 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRK-218ENST00000525459 CLRN1P58418 232 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRK-218ENST00000525459 ESRRGP62508 458 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRK-218ENST00000525459 PPP2R2BQ00005 443 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRK-218ENST00000525459 CAMK2DQ13557 499 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRK-218ENST00000525459 CDSNQ15517 529 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRK-218ENST00000525459 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRK-218ENST00000525459 C20orf196Q8IYI0 205 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRK-218ENST00000525459 EME1Q96AY2 570 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRK-218ENST00000525459 SAMD8Q96LT4 415 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRK-218ENST00000525459 CIB1Q99828 191 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRK-218ENST00000525459 TEX12Q9BXU0 123 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRK-218ENST00000525459 SMURF2Q9HAU4 748 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRK-218ENST00000525459 SLC24A3Q9HC58 644 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRK-218ENST00000525459 REV1Q9UBZ9 1251 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRK-218ENST00000525459 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRK-218ENST00000525459 ORC6Q9Y5N6 252 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRK-218ENST00000525459 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
PTPRK-218ENST00000525459 ALPK2Q86TB3 2170 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 RNF224P0DH78 156 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 IGFBP5P24593 272 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 ACVR1BP36896 505 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 DAPP51397 102 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 ERVK-25P63136 954 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 SLC36A3Q495N2 470 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 SSX8Q7RTT4 187 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 SNX18Q96RF0 628 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 KCNK17Q96T54 332 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 ULBP2Q9BZM5 246 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 USE1Q9NZ43 259 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 GPR52Q9Y2T5 361 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 PDLIM1O00151 329 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 BHLHE40O14503 412 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 SOX14O95416 240 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 PPP1R3DO95685 299 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 TP53P04637 393 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 EDNRAP25101 427 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 MPGP29372 298 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 FAPQ12884 760 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 HIST3H3Q16695 136 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 SLC27A4Q6P1M0 643 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 LNX2Q8N448 690 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM54Q969K7 222 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 TSSK6Q9BXA6 273 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 ENKD1Q9H0I2 346 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 GLTPQ9NZD2 209 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 IL20RAQ9UHF4 553 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 TRMUO75648 421 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 IGHV3-9P01782 118 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 PPP3CBP16298 524 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 ALDH3A2P51648 485 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 RAD23AP54725 363 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 DAG1Q14118 895 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 THEM4Q5T1C6 240 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 SFRP5Q5T4F7 317 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 CARD17Q5XLA6 110 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 OR7E24Q6IFN5 339 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 STEAP2Q8NFT2 490 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 Q96M85 177 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 PRRG3Q9BZD7 231 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 C16orf97H3BN30 126 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 UPK3AO75631 287 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 ALPLP05186 524 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 CD47Q08722 323 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 MESTQ5EB52 335 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 STAC2Q6ZMT1 411 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 JAZF1Q86VZ6 243 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 C17orf78Q8N4C9 275 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 OR8D4Q8NGM9 314 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 RBP7Q96R05 134 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 M0R3G1 203 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 EI24O14681 340 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 ARHGEF9O43307 516 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 IGHV1-2P23083 117 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 IL32P24001 234 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 GRK5P34947 590 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 UGT2B10P36537 528 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 BOD1Q96IK1 185 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 SLC25A19Q9HC21 320 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRK-218ENST00000525459 CRLF2Q9HC73 371 aa16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 181 ms