RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 IMPAD1Q9NX62 359 aa20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF6Q9Y252 685 aa20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 MEMO1Q9Y316 297 aa20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A0G2JNJ9 132 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 CCL21O00585 134 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 XKRYO14609 159 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR171O14626 319 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 UPK3AO75631 287 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 APEHP13798 732 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 PCYT1AP49585 367 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 CD47Q08722 323 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 GUSBP1Q15486 140 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 OTPQ5XKR4 325 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 PLBD1Q6P4A8 553 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM214BQ7L5A3 538 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 ENTHD1Q8IYW4 607 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 OR51L1Q8NGJ5 315 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 PLEKHA8Q96JA3 519 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC38A2Q96QD8 506 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 Q9UFV3 132 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 BAIAP2Q9UQB8 552 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 RIIAD1A6NNX1 92 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 H0YAE9 185 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 M0R3G1 203 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 DCTN6O00399 190 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 TNFSF13O75888 250 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 HMGN1P05114 100 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 PGA4P0DJD7 388 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 PGA3P0DJD8 388 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 TIMP3P35625 211 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 CDC42P60953 191 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 IL5RAQ01344 420 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 ITGADQ13349 1161 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 KEAP1Q14145 624 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF691Q5VV52 312 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 BTLAQ7Z6A9 289 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 CPOQ8IVL8 374 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNRF4Q8WWF5 429 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF566Q969W8 418 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 CNBD2Q96M20 576 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 PRSS50Q9UI38 385 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 PRSS37A4D1T9 235 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 IDH3BO43837 385 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 STSP08842 583 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 CLRN1P58418 232 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 ETFDHQ16134 617 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 TSPO2Q5TGU0 170 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 B3GLCTQ6Y288 498 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 GALNT11Q8NCW6 608 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 HTRA1Q92743 480 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 PTP4A1Q93096 173 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 DMRTA2Q96SC8 542 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNK17Q96T54 332 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 DDOQ99489 341 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC22A23A1A5C7 686 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 NPIPB13A6NJU9 1138 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 NPIPB4C9JG80 1138 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 E9PLN8 166 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 IGHG1P01857 330 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 EFNB1P98172 346 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 OR2A2Q6IF42 318 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 USP51Q70EK9 711 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 LINGO2Q7L985 606 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF100Q8IYN0 542 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 OR6N1Q8NGY5 312 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 CNIH3Q8TBE1 160 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 NSMAFQ92636 917 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 VKORC1Q9BQB6 163 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 TEX12Q9BXU0 123 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRTM2O43300 516 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 GPANK1O95872 356 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF3P17036 446 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 HSPA13P48723 471 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 LRFN4Q6PJG9 635 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 NOXO1Q8NFA2 376 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM45BQ96B21 275 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 STARD4Q96DR4 205 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 NUAK2Q9H093 628 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC7A10Q9NS82 523 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 EMC9Q9Y3B6 208 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM208BQ5VWN6 2430 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 A6NIZ1 184 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 IFNGP01579 166 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 CTLA4P16410 223 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 RAP1BP61224 184 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 RAP1AP62834 184 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-208ENST00000524325 C9orf135Q5VTT2 229 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms