RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 ZNF544Q6NX49 715 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 NOXRED1Q6NXP6 359 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 FUT10Q6P4F1 479 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 CXCL17Q6UXB2 119 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 FAM151BQ6UXP7 276 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 FAM92BQ6ZTR7 304 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 SLC24A5Q71RS6 500 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 GDPD3Q7L5L3 318 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 VTCN1Q7Z7D3 282 aa3.65□□□□□ -1.83
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SGCE-211ENST00000522045 UBQLNLQ8IYU4 475 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 SLC22A15Q8IZD6 547 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 OR10G2Q8NGC3 310 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 OR6F1Q8NGZ6 308 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 C17orf50Q8WW18 174 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 GGHQ92820 318 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
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SGCE-211ENST00000522045 MS4A10Q96PG2 267 aa3.65□□□□□ -1.83
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SGCE-211ENST00000522045 ATF6BQ99941 703 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 DOHHQ9BU89 302 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 ELOVL6Q9H5J4 265 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 TMEM38AQ9H6F2 299 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 NEK6Q9HC98 313 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 IL26Q9NPH9 171 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 DYRK4Q9NR20 520 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 POLE4Q9NR33 117 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 DNAJC11Q9NVH1 559 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 TMEM161AQ9NX61 479 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 ZNF226Q9NYT6 803 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 B4GALT7Q9UBV7 327 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 ATP6V1HQ9UI12 483 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 CRLS1Q9UJA2 301 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 ZNF221Q9UK13 617 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 TBC1D24Q9ULP9 559 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
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SGCE-211ENST00000522045 U3KQV3 271 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 V9GYH0 126 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 VWA8A3KMH1 1905 aa3.65□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 A0A1W2PQ67 120 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 SNURFLB1AK76 121 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 H0YIV9 168 aa3.64□□□□□ -1.83
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SGCE-211ENST00000522045 CCRL2O00421 344 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 ZW10O43264 779 aa3.64□□□□□ -1.83
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SGCE-211ENST00000522045 GJB5O95377 273 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 OLFM2O95897 454 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 LGI1O95970 557 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 IGSF6O95976 241 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 HLA-DQB1P01920 261 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 STSP08842 583 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 ALPIP09923 528 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 OR56A5P0C7T3 313 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 DBTP11182 482 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 CD22P20273 847 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 RRM2P31350 389 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 CCR7P32248 378 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 SOX6P35712 828 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 SOX3P41225 446 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 CSKP41240 450 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 XCR1P46094 333 aa3.64□□□□□ -1.83
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SGCE-211ENST00000522045 KRTAP10-1P60331 282 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 COPZ1P61923 177 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 TWF1Q12792 350 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 ASAH1Q13510 395 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 RGNQ15493 299 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 CHRNA6Q15825 494 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 FAM189A2Q15884 450 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 SSX1Q16384 188 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 C3AR1Q16581 482 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 MICAQ29983 383 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 LRRC26Q2I0M4 334 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 SPIN4Q56A73 249 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 ARMCX4Q5H9R4 360 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 SPANXN2Q5MJ10 180 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 ATAD3CQ5T2N8 411 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 HECTD3Q5T447 861 aa3.64□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 LCE1CQ5T751 118 aa3.64□□□□□ -1.83
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