RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516230.1

RNU6-287P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 287, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-287P, Length 98 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-287P-201ENST00000516230 UGT1A10Q9HAW8 530 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 UGT1A8Q9HAW9 530 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 MAGEF1Q9HAY2 307 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF286AQ9HBT8 521 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 PALMDQ9NP74 551 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 NARFQ9UHQ1 456 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 IKZF2Q9UKS7 526 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 DDX19BQ9UMR2 479 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 GPR34Q9UPC5 381 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 PSG8Q9UQ74 426 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCL27Q9Y4X3 112 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 IKBKGQ9Y6K9 419 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 DOCK10Q96BY6 2186 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 SACSQ9NZJ4 4579 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRR14LQ5THK1 2151 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 ICE1Q9Y2F5 2266 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 A0A1B0GUH1 482 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 A8MXE2 369 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 LEUTXA8MZ59 168 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 H3BTX0 84 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 DCTN6O00399 190 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRKYO43930 277 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 NME2P1O60361 137 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 NME6O75414 186 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 STX11O75558 287 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 SYNGR4O95473 234 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 CDS2O95674 445 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 STARD3NLO95772 234 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 FERP16591 822 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 HLA-DMAP28067 261 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 CASP14P31944 242 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 ADRA1AP35348 466 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 CDKN2BP42772 138 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 MAGEA4P43358 317 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 HTR5AP47898 357 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 LGALS7P47929 136 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRKXP51817 358 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 UBE2E1P51965 193 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 CASP9P55211 416 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCZ1BP86790 482 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 TSPY1Q01534 308 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRPSAP1Q14558 356 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 KYNUQ16719 465 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 PARP15Q460N3 678 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 TEX30Q5JUR7 227 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCDC158Q5M9N0 1113 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 NEK5Q6P3R8 708 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRSS54Q6PEW0 395 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM205Q6UW68 189 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 LINC00173Q6ZV60 143 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC16A13Q7RTY0 426 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 KLHL7Q8IXQ5 586 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF101Q8IZC7 436 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 C15orf54Q8N8G6 183 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZFP41Q8N8Y5 198 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 STEAP2Q8NFT2 490 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR4A16Q8NH70 328 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 CNIH3Q8TBE1 160 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 FGF11Q92914 225 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 CFAP36Q96G28 342 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 PAGE5Q96GU1 130 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 EPSTI1Q96J88 318 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZFP3Q96NJ6 502 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 PANX3Q96QZ0 392 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 RBBP8Q99708 897 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 GABARAPL3Q9BY60 117 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 TRPV6Q9H1D0 765 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 TUBA4BQ9H853 241 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 HOXC10Q9NYD6 342 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 C21orf62Q9NYP8 219 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 IL37Q9NZH6 218 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 C5AR2Q9P296 337 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 XCL2Q9UBD3 114 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZMYM6O95789 1325 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 MYO7AQ13402 2215 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 VPS13CQ709C8 3753 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 ADGRB3O60242 1522 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms