RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-208	ENST00000511276	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FAM53C-208	ENST00000511276	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FAM53C-208	ENST00000511276	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FAM53C-208	ENST00000511276	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FAM53C-208	ENST00000511276	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FAM53C-208	ENST00000511276	COL7A1	Q02388	2944 aa		11.15	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276		A8MXK9	166 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	UBL3	O95164	117 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	IGHV1-46	P01743	117 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	IGHV2-70	P01814	119 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	MT-ND5	P03915	603 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	CSF1	P09603	554 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	PATE4	P0C8F1	98 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	MAPK1	P28482	360 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF81	P51508	661 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	HPCA	P84074	193 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	RBBP4	Q09028	425 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	CAMK2D	Q13557	499 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM209A	Q5JX71	171 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	RNF130	Q86XS8	419 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	CADM2	Q8N3J6	435 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	UPRT	Q96BW1	309 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	EMCN	Q9ULC0	261 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	NPTN	Q9Y639	398 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	TM9SF1	O15321	606 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	SPRY3	O43610	288 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	AHSA1	O95433	338 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	CHEK2	O96017	543 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	GKN3P	P0CG01	181 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	CCL2	P13500	99 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	DRD4	P21917	467 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	DNAJB13	P59910	316 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	MOG	Q16653	247 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276		Q6YL49	198 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	FOXB1	Q99853	325 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	C1orf50	Q9BV19	199 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	TENM3	Q9P273	2699 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276		A0A1W2PPM1	405 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	PEX11A	O75192	247 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	KRT34	O76011	436 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	IGHV3-13	P01766	116 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	IL7R	P16871	459 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	KRT4	P19013	534 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	PRPS1L1	P21108	318 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC18A1	P54219	525 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	PGS1	Q32NB8	556 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	KANK2	Q63ZY3	851 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	ATG16L1	Q676U5	607 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	SKA3	Q8IX90	412 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	SPIC	Q8N5J4	248 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM86B	Q8N661	226 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	STK35	Q8TDR2	534 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	ZBTB9	Q96C00	473 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	APOPT1	Q96IL0	206 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	LRR1	Q96L50	414 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	EMC6	Q9BV81	110 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	DPY30	Q9C005	99 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	CDH20	Q9HBT6	801 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	NOX4	Q9NPH5	578 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	RLIM	Q9NVW2	624 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276		A0A096LPI6	279 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	TYROBP	O43914	113 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	PIP5K1C	O60331	668 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	GLRA3	O75311	464 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	OPN1MW	P04001	364 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		11.11	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms