RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	LY75	O60449	1722 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549		A6NCN8	305 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM183A	A6NL82	134 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	NME2P1	O60361	137 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	KAT7	O95251	611 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TGFB1	P01137	390 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ELFN1	P0C7U0	828 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CALCB	P10092	127 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCL23	P55773	120 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	RAB11B	Q15907	218 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	XKR4	Q5GH76	650 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR8U1	Q8NH10	309 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	BBS10	Q8TAM1	723 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPR119	Q8TDV5	335 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MALSU1	Q96EH3	234 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRRC1	Q96M27	445 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TP53RK	Q96S44	253 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	GAB2	Q9UQC2	676 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	NUP205	Q92621	2012 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	UNC119B	A6NIH7	251 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549		M0R3H8	397 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SCGB1D2	O95969	90 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TM4SF1	P30408	202 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PBX2	P40425	430 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	HMGCS2	P54868	508 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	DLK1	P80370	383 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	METTL7B	Q6UX53	244 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	IL21R	Q9HBE5	538 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	LRFN1	Q9P244	771 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	STARD10	Q9Y365	291 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549		A8MWP6	167 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549		K7ERQ8	282 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLDN11	O75508	207 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	FGF19	O95750	216 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TBP	P20226	339 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	GABRR1	P24046	479 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	EDNRB	P24530	442 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	BMP8B	P34820	402 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR1G1	P47890	313 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	KHK	P50053	298 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	HERPUD1	Q15011	391 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TP53I3	Q53FA7	332 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	WSCD1	Q658N2	575 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	HAS2	Q92819	552 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MOAP1	Q96BY2	351 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	WDR92	Q96MX6	357 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MARCH5	Q9NX47	278 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRIP11	Q15643	1979 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A0G2JN53	185 aa		7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	IFITM5	A6NNB3	132 aa		7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549		A8MXE2	369 aa		7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	EREG	O14944	169 aa		7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	IRAK2	O43187	625 aa		7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR1F1	O43749	312 aa		7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPR37L1	O60883	481 aa		7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	HBA1	P69905	142 aa		7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PAX5	Q02548	391 aa		7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	GAS6	Q14393	721 aa		7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MIDN	Q504T8	468 aa		7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	COX20	Q5RI15	118 aa		7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	OPN5	Q6U736	354 aa		7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	VIT	Q6UXI7	678 aa		7.52	□□□□□ -1.2

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