RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 MUC3AQ02505 3323 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 ALOX12BO75342 701 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF682O95780 498 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHEP01854 428 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 MT-ND1P03886 318 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 CLPSP04118 112 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 CHRM4P08173 479 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 RAB40ALP0C0E4 278 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 JMJD7P0C870 316 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 OR8G3PP0DMU2 310 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC2A1P11166 492 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF28P17035 718 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 CRYBA2P53672 197 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 DCAF7P61962 342 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 FOXK1P85037 733 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 DUSP8Q13202 625 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 NSDHLQ15738 373 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 SYPL1Q16563 259 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 DUSP5Q16690 384 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 IFI44LQ53G44 452 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 HES3Q5TGS1 186 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 AHSA2Q719I0 299 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 ANKRD37Q7Z713 158 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 ZFP82Q8N141 532 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 FTMTQ8N4E7 242 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM86B1Q8N7N1 296 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 DEFB124Q8NES8 71 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 OR13C3Q8NGS6 347 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 MOSPD2Q8NHP6 518 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 COQ8AQ8NI60 647 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 STK35Q8TDR2 534 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 VSTM2LQ96N03 204 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 SPSB2Q99619 263 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 ASPNQ9BXN1 380 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 TEX12Q9BXU0 123 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 ULBP3Q9BZM4 244 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10A5Q9H207 317 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC38A1Q9H2H9 487 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 DLL4Q9NR61 685 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 THSD1Q9NS62 852 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 WASF3Q9UPY6 502 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 NPTNQ9Y639 398 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 CACNA1HO95180 2353 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 PTPRBP23467 1997 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 OR6C68A6NDL8 312 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 IDSB3KWA1 339 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 DISC1C4P0D8 188 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 SYT5O00445 386 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 ADAMDEC1O15204 470 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 HCRTR2O43614 444 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 DDAH2O95865 285 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 HPP00738 406 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 IGKV3-11P04433 115 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 FABP3P05413 133 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 DDTP30046 118 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 EFNA3P52797 238 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 EMP2P54851 167 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 PKIAP61925 76 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 GAGE1Q13065 139 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 DCST2Q5T1A1 773 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM205Q6UW68 189 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 DHRS13Q6UX07 377 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC34A3Q8N130 599 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 COX18Q8N8Q8 333 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF383Q8NA42 475 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5J2Q8NH18 312 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC2A12Q8TD20 617 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF721Q8TF20 911 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 METTL21AQ8WXB1 218 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 CDS1Q92903 461 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 MR1Q95460 341 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 MISP3Q96FF7 219 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 RHOVQ96L33 236 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 LRR1Q96L50 414 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 CNPPD1Q9BV87 410 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 SPRY4Q9C004 299 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF350Q9GZX5 532 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 OR51J1Q9H342 316 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 ANKRA2Q9H9E1 313 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
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