RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 ZNF141Q15928 474 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 OTPQ5XKR4 325 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PYHIN1Q6K0P9 492 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PAMR1Q6UXH9 720 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CEACAM19Q7Z692 300 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNF565Q8N9K5 539 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ELOA3Q8NG57 546 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 MOSPD2Q8NHP6 518 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
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HERC4-211ENST00000492996 WDFY2Q96P53 400 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SDHAF3Q9NRP4 125 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ASB6Q9NWX5 421 aa6.37□□□□□ -1.39
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HERC4-211ENST00000492996 NPIPB9F8W1W9 429 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 J3QRE1 110 aa6.36□□□□□ -1.39
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HERC4-211ENST00000492996 NUDT14O95848 222 aa6.36□□□□□ -1.39
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HERC4-211ENST00000492996 F13BP05160 661 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PSMB10P40306 273 aa6.36□□□□□ -1.39
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HERC4-211ENST00000492996 ZNF85Q03923 595 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 FUT7Q11130 342 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 C3orf49Q96BT1 292 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNF524Q96C55 264 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZDHHC12Q96GR4 267 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 Q96M85 177 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ATF6BQ99941 703 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 TRABD2BA6NFA1 517 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 H3BSH0 61 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 H7C1C5 153 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNF749O43361 778 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SELENOFO60613 162 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 S100A9P06702 114 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 FOLR1P15328 257 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ITPKBP27987 946 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 LCN6P62502 163 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 NSDHLQ15738 373 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 AANATQ16613 207 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 TBR1Q16650 682 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
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HERC4-211ENST00000492996 TCTE1Q5JU00 501 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 XKRXQ6PP77 449 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 GPR135Q8IZ08 494 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 Q8N402 240 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNF563Q8TA94 476 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 NANPQ8TBE9 248 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.36□□□□□ -1.39
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HERC4-211ENST00000492996 MOGAT1Q96PD6 335 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.36□□□□□ -1.39
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HERC4-211ENST00000492996 RTN4RQ9BZR6 473 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SESN1Q9Y6P5 492 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 FRYLO94915 3013 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 COL6A3P12111 3177 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 A0A087WUJ7 227 aa6.35□□□□□ -1.39
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HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PQM1 296 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 OR6C68A6NDL8 312 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 IDSB3KWA1 339 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SCDO00767 359 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 FABP1P07148 127 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 MAGEB1P43366 347 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 GPR143P51810 404 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 EFNA3P52797 238 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 TRIQKQ629K1 86 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNF511Q8NB15 262 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 OR4M2Q8NGB6 313 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 OR4M1Q8NGD0 313 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 OR1L3Q8NH93 324 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ENKURQ8TC29 256 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SNX33Q8WV41 574 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa6.35□□□□□ -1.39
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