RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF850A8MQ14 1090 aa11.33□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 C2orf74A8MZ97 194 aa11.33□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 SEC14L5O43304 696 aa11.33□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 SYT7O43581 403 aa11.33□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 RBMXP38159 391 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
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TRIOBP-211ENST00000492485 SLC36A2Q495M3 483 aa11.33□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM69BQ5VUD6 431 aa11.33□□□□□ -0.6
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TRIOBP-211ENST00000492485 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 MED25Q71SY5 747 aa11.33□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 IL17RCQ8NAC3 791 aa11.33□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa11.33□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 OR4D6Q8NGJ1 314 aa11.33□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 GAL3ST3Q96A11 431 aa11.33□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 KLHL42Q9P2K6 505 aa11.33□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 ASCL1P50553 236 aa11.33□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 CLEC12BQ2HXU8 276 aa11.33□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 CD276Q5ZPR3 534 aa11.33□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 C9orf62Q8N4C0 152 aa11.33□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 OR4C16Q8NGL9 310 aa11.33□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 PTP4A1Q93096 173 aa11.33□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
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TRIOBP-211ENST00000492485 MARVELD1Q9BSK0 173 aa11.33□□□□□ -0.6
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TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF726A6NNF4 738 aa11.32□□□□□ -0.6
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TRIOBP-211ENST00000492485 LATS1O95835 1130 aa11.32□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 ENPP1P22413 925 aa11.32□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 REEP5Q00765 189 aa11.32□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa11.32□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa11.32□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM3DQ96BQ1 224 aa11.32□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 RGCCQ9H4X1 137 aa11.32□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 DLL4Q9NR61 685 aa11.32□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 ABRACLQ9P1F3 81 aa11.32□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 CAMK2AQ9UQM7 478 aa11.32□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM96BQ9Y3D0 163 aa11.32□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP11.32□□□□□ -0.6
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TRIOBP-211ENST00000492485 IFITM5A6NNB3 132 aa11.32□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 SHISA8B8ZZ34 492 aa11.32□□□□□ -0.6
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TRIOBP-211ENST00000492485 COL24A1Q17RW2 1714 aa11.32□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM122CQ6P4D5 195 aa11.32□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 Q6ZNB5 142 aa11.32□□□□□ -0.6
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TRIOBP-211ENST00000492485 SLC25A19Q9HC21 320 aa11.32□□□□□ -0.6
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TRIOBP-211ENST00000492485 NPC1O15118 1278 aa11.32□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF208O43345 1280 aa11.32□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 GAAP10253 952 aa11.32□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 SERPINA2P20848 420 aa11.32□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 IL32P24001 234 aa11.32□□□□□ -0.6
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TRIOBP-211ENST00000492485 CLDN6P56747 220 aa11.32□□□□□ -0.6
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TRIOBP-211ENST00000492485 PPP2CAP67775 309 aa11.32□□□□□ -0.6
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TRIOBP-211ENST00000492485 DUSP6Q16828 381 aa11.32□□□□□ -0.6
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TRIOBP-211ENST00000492485 METTL7AQ9H8H3 244 aa11.32□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 HIF3AQ9Y2N7 669 aa11.32□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
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TRIOBP-211ENST00000492485 MED6O75586 246 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 LPLP06858 475 aa11.31□□□□□ -0.6
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TRIOBP-211ENST00000492485 YIPF5Q969M3 257 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 KLHL15Q96M94 604 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 RBP7Q96R05 134 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 MAP3K3Q99759 626 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 SUCNR1Q9BXA5 334 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 EMC7Q9NPA0 242 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 CHST11Q9NPF2 352 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
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