RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 NKAIN4Q8IVV8 208 aa24■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 CDK20Q8IZL9 346 aa24■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 SLC26A7Q8TE54 656 aa24■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM160Q9NX00 188 aa24■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 MRASO14807 208 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 NPPAP01160 153 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 PGA4P0DJD7 388 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 PGA3P0DJD8 388 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 CD79AP11912 226 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 UGT2B15P54855 530 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP23.99■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 MELKQ14680 651 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 SPATA21Q7Z572 469 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 SKA3Q8IX90 412 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 SH3GLB1Q9Y371 365 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 BBIP1A8MTZ0 92 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 OR6A2O95222 327 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 PATE4P0C8F1 98 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 GIPRP48546 466 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 ARFIP2P53365 341 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 HIST3H3Q16695 136 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 CYB5R2Q6BCY4 276 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 SNX32Q86XE0 403 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 PFN4Q8NHR9 129 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 C10orf82Q8WW14 230 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 SEPHS2Q99611 448 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 SH3GL1Q99961 368 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 ECSITQ9BQ95 431 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 PIMREGQ9BSJ6 248 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 RNF13O43567 381 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 MT-ND1P03886 318 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 TSPAN19P0C672 248 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP23.97■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 RAB1AP62820 205 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 RUNX1T1Q06455 604 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 GGTLC2Q14390 218 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 FXNQ16595 210 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 CHRFAM7AQ494W8 412 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF566Q969W8 418 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 C20orf141Q9NUB4 165 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM38BQ9NVV0 291 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 GIFP27352 417 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM255BQ8WV15 326 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 BPESC1Q9GZL8 116 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 RAB1BQ9H0U4 201 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 MRGBPQ9NV56 204 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 BAG5Q9UL15 447 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB3-211ENST00000490677 UBL3O95164 117 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 OR5F1O95221 314 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 STAMBPO95630 424 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 IGF2P01344 180 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 FUT4P22083 530 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 RBM34P42696 430 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 OR1E2P47887 323 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 RAB39AQ14964 217 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 ERICH5Q6P6B1 374 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 SLC22A24Q8N4F4 322 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 LIPHQ8WWY8 451 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 SOX7Q9BT81 388 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 RIMS3Q9UJD0 308 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 STAB1Q9NY15 2570 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 LOC100653049A0A140TA62 436 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 FAM220BPB1ANY3 271 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 DHHO43323 396 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 KRT34O76011 436 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 GLRXP35754 106 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 EVX1P49640 407 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 MMEL1Q495T6 779 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 KCNK17Q96T54 332 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC134Q9H6E4 229 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 CMAHPQ9Y471 501 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 OR7A10O76100 309 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 QDPRP09417 244 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 FAM157CP0CG43 387 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 UMPSP11172 480 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB3-211ENST00000490677 DAOP14920 347 aa23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms