RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489390.1

SHOC2-205, Transcript of SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein, human

TSL 5

Gene SHOC2, Length 815 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHOC2-205	ENST00000489390	DRD4	P21917	467 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	EGR4	Q05215	589 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	ATG16L1	Q676U5	607 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	SPIC	Q8N5J4	248 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	CCDC63	Q8NA47	563 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	UPRT	Q96BW1	309 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	C1orf198	Q9H425	327 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	CDH20	Q9HBT6	801 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	NPHS2	Q9NP85	383 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	RNF114	Q9Y508	228 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	OR2T1	O43869	369 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	SNAP29	O95721	258 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	PATE4	P0C8F1	98 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	ARRB2	P32121	409 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	CD80	P33681	288 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	CCT5	P48643	541 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	UCP2	P55851	309 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	GLO1	Q04760	184 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	PMS2P3	Q13401	168 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	UEVLD	Q8IX04	471 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	SKA3	Q8IX90	412 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	TMEM86B	Q8N661	226 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	C3orf30	Q96M34	536 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	EMC6	Q9BV81	110 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	OR51B6	Q9H340	312 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	NOX4	Q9NPH5	578 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SHOC2-205	ENST00000489390		A0A1W2PPM1	405 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	C5orf63	A6NC05	138 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390		G3V4G9	280 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	SPRY3	O43610	288 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	MFN2	O95140	757 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	CHRNG	P07510	517 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	ADH4	P08319	380 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	SBK2	P0C263	348 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	CCL2	P13500	99 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	MMP15	P51511	669 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	PROK1	P58294	105 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	LIN52	Q52LA3	116 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390		Q6YL49	198 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	ANKRD46	Q86W74	232 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	CHIA	Q9BZP6	476 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	PLSCR5	A0PG75	271 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	MS4A18	H0YCH9	400 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	TRIM13	O60858	407 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	ENTPD5	O75356	428 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	PRG2	P13727	222 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	HLA-DOB	P13765	273 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	ECHS1	P30084	290 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	GRPR	P30550	384 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	CRHR1	P34998	444 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	PCLAF	Q15004	111 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		11.94	□□□□□ -0.5

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