RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487547.1

USP34-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

TSL 3

Gene USP34, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-216ENST00000487547 WDR62O43379 1518 aa3.23□□□□□ -1.89
USP34-216ENST00000487547 MSH6P52701 1360 aa3.23□□□□□ -1.89
USP34-216ENST00000487547 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
USP34-216ENST00000487547 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa3.22□□□□□ -1.89
USP34-216ENST00000487547 H0YHG0 523 aa3.22□□□□□ -1.89
USP34-216ENST00000487547 PTMAP06454 111 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
USP34-216ENST00000487547 YAP1P46937 504 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
USP34-216ENST00000487547 RPS21P63220 83 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
USP34-216ENST00000487547 CDK16Q00536 496 aa3.22□□□□□ -1.89
USP34-216ENST00000487547 FGL1Q08830 312 aa3.22□□□□□ -1.89
USP34-216ENST00000487547 STK11Q15831 433 aa3.22□□□□□ -1.89
USP34-216ENST00000487547 CFAP157Q5JU67 520 aa3.22□□□□□ -1.89
USP34-216ENST00000487547 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
USP34-216ENST00000487547 ATAD3BQ5T9A4 648 aa3.22□□□□□ -1.89
USP34-216ENST00000487547 SLC25A24Q6NUK1 477 aa3.22□□□□□ -1.89
USP34-216ENST00000487547 SLC25A34Q6PIV7 304 aa3.22□□□□□ -1.89
USP34-216ENST00000487547 TRIM69Q86WT6 500 aa3.22□□□□□ -1.89
USP34-216ENST00000487547 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
USP34-216ENST00000487547 OR2T3Q8NH03 318 aa3.22□□□□□ -1.89
USP34-216ENST00000487547 LRRC58Q96CX6 371 aa3.22□□□□□ -1.89
USP34-216ENST00000487547 SORT1Q99523 831 aa3.22□□□□□ -1.89
USP34-216ENST00000487547 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
USP34-216ENST00000487547 FAIM2Q9BWQ8 316 aa3.22□□□□□ -1.89
USP34-216ENST00000487547 ING2Q9H160 280 aa3.22□□□□□ -1.89
USP34-216ENST00000487547 AZI2Q9H6S1 392 aa3.22□□□□□ -1.89
USP34-216ENST00000487547 ADAP2Q9NPF8 381 aa3.22□□□□□ -1.89
USP34-216ENST00000487547 ZNF222Q9UK12 451 aa3.22□□□□□ -1.89
USP34-216ENST00000487547 A0A0B4J2A0 478 aa3.21□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 A0A1B0GVI7 797 aa3.21□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 RCBTB2O95199 551 aa3.21□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 CD1CP29017 333 aa3.21□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 NAMPTP43490 491 aa3.21□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 SLC7A9P82251 487 aa3.21□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 PDK3Q15120 406 aa3.21□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 HES5Q5TA89 166 aa3.21□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 TRIM40Q6P9F5 258 aa3.21□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 TMEM179Q6ZVK1 233 aa3.21□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 SYNPRQ8TBG9 265 aa3.21□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 STMN2Q93045 179 aa3.21□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 SGK3Q96BR1 496 aa3.21□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 POLE4Q9NR33 117 aa3.21□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 SHPKQ9UHJ6 478 aa3.21□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 GGA2Q9UJY4 613 aa3.21□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa3.21□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa3.2□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 NDC80O14777 642 aa3.2□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 ERCC8Q13216 396 aa3.2□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 COX19Q49B96 90 aa3.2□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 ZNF836Q6ZNA1 936 aa3.2□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 NEGR1Q7Z3B1 354 aa3.2□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 CEP112Q8N8E3 955 aa3.2□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa3.2□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 SLC39A3Q9BRY0 314 aa3.2□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 OSBPL11Q9BXB4 747 aa3.2□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 SIRT7Q9NRC8 400 aa3.2□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 ZNRD1Q9P1U0 126 aa3.2□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 CDH9Q9ULB4 789 aa3.2□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa3.2□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 TRAV39A0A0B4J263 110 aa3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 COLCA2A8K830 154 aa3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 FCMRO60667 390 aa3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 ERLIN2O94905 339 aa3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 IGHV2-5P01817 119 aa3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 AK4P27144 223 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 RAP1AP62834 184 aa3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 OGDHQ02218 1023 aa3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 KLHL30Q0D2K2 578 aa3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 PRSS8Q16651 343 aa3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 PDZK1Q5T2W1 519 aa3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 Q5W150 140 aa3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 ZNF880Q6PDB4 577 aa3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 LINC00173Q6ZV60 143 aa3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 BIVMQ86UB2 503 aa3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 PDXPQ96GD0 296 aa3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 HSFY1Q96LI6 401 aa3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 MS4A4EQ96PG1 132 aa3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 RNF157Q96PX1 679 aa3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 OR8B4Q96RC9 309 aa3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 HMG20AQ9NP66 347 aa3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa3.18□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 A0A1B0GVX0 72 aa3.18□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 C7orf66A4D0T2 115 aa3.18□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 KMOO15229 486 aa3.18□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 GMFGO60234 142 aa3.18□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 OR7A10O76100 309 aa3.18□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 C2P06681 752 aa3.18□□□□□ -1.9
USP34-216ENST00000487547 IGKV1-13P0DP09 117 aa3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms