RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486032.1

COPS3-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 3, human

TSL 2

Gene COPS3, Length 725 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS3-208	ENST00000486032	CBR4	Q8N4T8	237 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	OTULIN	Q96BN8	352 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	RASD2	Q96D21	266 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	SLC29A1	Q99808	456 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	RERGL	Q9H628	205 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	RNF122	Q9H9V4	155 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	EMC3	Q9P0I2	261 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	PRSS50	Q9UI38	385 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	MED12L	Q86YW9	2145 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032		M0R3G1	203 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	GPR171	O14626	319 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	DVL2	O14641	736 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	KLF4	O43474	513 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	PTP4A3	O75365	173 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	UPK3A	O75631	287 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	VAMP5	O95183	116 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	ATP6V1G2	O95670	118 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	IGF2	P01344	180 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	OSM	P13725	252 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	EDNRA	P25101	427 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	UQCRC1	P31930	480 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	NTF4	P34130	210 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	OPRM1	P35372	400 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	CENPA	P49450	140 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	CLRN1	P58418	232 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	FXYD6P3	P58550	94 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	PRPS1	P60891	318 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	H3F3A	P84243	136 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	SLC34A1	Q06495	639 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	CD47	Q08722	323 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	ZP4	Q12836	540 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	FAP	Q12884	760 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	GK3P	Q14409	553 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	TSC22D1	Q15714	1073 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	ACKR1	Q16570	336 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	RFX4	Q33E94	735 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	MTFR2	Q6P444	385 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	PXK	Q7Z7A4	578 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	SYT14	Q8NB59	555 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COPS3-208	ENST00000486032	ASB5	Q8WWX0	329 aa		4.98	□□□□□ -1.61

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