RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 RNF217Q8TC41 542 aa8.06□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 RDH5Q92781 318 aa8.06□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 YIPF5Q969M3 257 aa8.06□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC41A3Q96GZ6 507 aa8.06□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 TXNDC15Q96J42 360 aa8.06□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 LRR1Q96L50 414 aa8.06□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 MOGAT1Q96PD6 335 aa8.06□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 OR52B2Q96RD2 323 aa8.06□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 ULBP2Q9BZM5 246 aa8.06□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 MS4A5Q9H3V2 200 aa8.06□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa8.06□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 POFUT2Q9Y2G5 429 aa8.06□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.06□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 NOX1Q9Y5S8 564 aa8.06□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 LRRN3E7EW58 273 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 PPIHO43447 177 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 TPST1O60507 370 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 RP2O75695 350 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 SERPINI2O75830 405 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB36O95755 333 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 TFP02787 698 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 PATE4P0C8F1 98 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 NAT2P11245 290 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 CSNK1A1P48729 337 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM33P57088 247 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 LMO4P61968 165 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 RPS23P62266 143 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB1AP62820 205 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 IL13RA1P78552 427 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 GALK2Q01415 458 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 PUDPQ08623 228 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 PMS2P3Q13401 168 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB39AQ14964 217 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 CEP85LQ5SZL2 805 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 GCNT6Q5T4J0 391 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM91A1Q658Y4 838 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 REP15Q6BDI9 236 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 LEG1Q6P5S2 330 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 ULK3Q6PHR2 472 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC2A7Q6PXP3 512 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF584Q8IVC4 421 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 MSRB3Q8IXL7 192 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 C10orf111Q8N326 155 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 MIER2Q8N344 545 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 OR6N1Q8NGY5 312 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 OR6S1Q8NH40 331 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 NFKBIDQ8NI38 313 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 MGARPQ8TDB4 240 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC47A1Q96FL8 570 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 CCT8L2Q96SF2 557 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 EPYCQ99645 322 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 ASPNQ9BXN1 380 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 SLITRK2Q9H156 845 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 MMP27Q9H306 513 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 RAD21L1Q9H4I0 556 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 G6PC2Q9NQR9 355 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 DUSP13Q9UII6 198 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 V9GYY5 206 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAV20A0A0B4J274 112 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A0B4J2E0 115 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1B0GX12 115 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1W2PPW3 197 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM120BA0PK00 339 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF726A6NNF4 738 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 POM121CA8CG34 1229 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 PLPP3O14495 311 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 UBDO15205 165 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 TPST2O60704 377 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 PRSS23O95084 383 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 UBL3O95164 117 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 PRTN3P24158 256 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 GCH1P30793 250 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 NCALDP61601 193 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 OR1Q1Q15612 314 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 REEP3Q6NUK4 255 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 Q6ZPA2 131 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 PXKQ7Z7A4 578 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 SNX32Q86XE0 403 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 KRT73Q86Y46 540 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 SKA3Q8IX90 412 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 C10orf53Q8N6V4 93 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 FGFBP3Q8TAT2 258 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-210ENST00000481231 LRRC58Q96CX6 371 aa8.04□□□□□ -1.12
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