RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	LAPTM4A	Q15012	233 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	GSG1	Q2KHT4	349 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	C16orf89	Q6UX73	402 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	NRM	Q8IXM6	262 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	OR51A7	Q8NH64	312 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	OR6X1	Q8NH79	312 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	FOXB1	Q99853	325 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	SMR3A	Q99954	134 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SSR4-208	ENST00000471880	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	SSX4	O60224	188 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	TMCC2	O75069	709 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFS7	O75251	213 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	RAB36	O95755	333 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	QDPR	P09417	244 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	INHBB	P09529	407 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	BMP4	P12644	408 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	PAX7	P23759	505 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	ARR3	P36575	388 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	GPR4	P46093	362 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF84	P51523	738 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	NUDT6	P53370	316 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	NAAA	Q02083	359 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	CHRNB3	Q05901	458 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	CD47	Q08722	323 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	KRT72	Q14CN4	511 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	ALG10	Q5BKT4	473 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF347	Q96SE7	839 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	CDRT15	Q96T59	188 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	RNF121	Q9H920	327 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	CR1	P17927	2039 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	DIRAS1	O95057	198 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	CD8A	P01732	235 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	CBR1	P16152	277 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	FUT4	P22083	530 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	ACVR1B	P36896	505 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	RAB35	Q15286	201 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF544	Q6NX49	715 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	OAF	Q86UD1	273 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	DTX2	Q86UW9	622 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM54	Q969K7	222 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	NDE1	Q9NXR1	346 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	ZFHX3	Q15911	3703 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	OVOL3	O00110	214 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	FFAR1	O14842	300 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	DHH	O43323	396 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV4-39	P01824	125 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	PATE4	P0C8F1	98 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	PGA4	P0DJD7	388 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	PGA3	P0DJD8	388 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	FOSL1	P15407	271 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	ACADS	P16219	412 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	MAK	P20794	623 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	CALCR	P30988	508 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	GIPR	P48546	466 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	MNAT1	P51948	309 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	CTXN1	P60606	82 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	RAB1A	P62820	205 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	RUNX1T1	Q06455	604 aa		12.87	□□□□□ -0.35

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