RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470268.1

SF3B1-208, Transcript of splicing factor 3b subunit 1, human

TSL 2

Gene SF3B1, Length 2,003 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SF3B1-208	ENST00000470268	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SF3B1-208	ENST00000470268	SVOPL	Q8N434	492 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SF3B1-208	ENST00000470268	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SF3B1-208	ENST00000470268	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SF3B1-208	ENST00000470268	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SF3B1-208	ENST00000470268	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SF3B1-208	ENST00000470268	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SF3B1-208	ENST00000470268	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SF3B1-208	ENST00000470268	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SF3B1-208	ENST00000470268	HHATL	Q9HCP6	504 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SF3B1-208	ENST00000470268	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SF3B1-208	ENST00000470268	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SF3B1-208	ENST00000470268	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SF3B1-208	ENST00000470268	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SF3B1-208	ENST00000470268	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SF3B1-208	ENST00000470268	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SF3B1-208	ENST00000470268	MED12	Q93074	2177 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SF3B1-208	ENST00000470268	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SF3B1-208	ENST00000470268	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268		A0A1B0GTH9	108 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268		A0A1B0GVC2	190 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	LIPT2	A6NK58	231 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268		H3BSA7	217 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	TNFSF11	O14788	317 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	FZD7	O75084	574 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	PTP4A3	O75365	173 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	TUSC2	O75896	110 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	AKR7A3	O95154	331 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	SOX14	O95416	240 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	ADA	P00813	363 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	IGF2	P01344	180 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	TFPI	P10646	304 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF708	P17019	499 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	MYF6	P23409	242 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	FPR3	P25089	353 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	GRPR	P30550	384 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	CAPG	P40121	348 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	DIO1	P49895	249 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	P2RY4	P51582	365 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	MAP2K6	P52564	334 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	ARHGDIA	P52565	204 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	MLLT10	P55197	1068 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	KLRB1	Q12918	225 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	TSPAN31	Q12999	210 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	APOF	Q13790	326 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	OR7A5	Q15622	319 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	USP51	Q70EK9	711 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	RRM2B	Q7LG56	351 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	KDM8	Q8N371	416 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	OR51A7	Q8NH64	312 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	PIGX	Q8TBF5	258 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	FAR1	Q8WVX9	515 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	LIPH	Q8WWY8	451 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	MIB2	Q96AX9	1013 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	DDIT4L	Q96D03	193 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	SGTB	Q96EQ0	304 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	KLHL15	Q96M94	604 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	GPR137	Q96N19	417 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	OR5B2	Q96R09	309 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268		Q9H521	79 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	USE1	Q9NZ43	259 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268		E9PQ18	207 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	MS4A18	H0YCH9	400 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268		H0YJX3	145 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	SULT2B1	O00204	365 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	XPNPEP2	O43895	674 aa		4.21	□□□□□ -1.74

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