RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469602.1

SRRT-208, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 376 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-208ENST00000469602 CENPBD1B2RD01 187 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 MCIDASD6RGH6 385 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 SMPD2O60906 423 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 TMCC2O75069 709 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 SEC14L2O76054 403 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 DIRAS1O95057 198 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 IGHG1P01857 330 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 PGA4P0DJD7 388 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 PGA3P0DJD8 388 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 B4GALT1P15291 398 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 ATP6V1B2P21281 511 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 GPR4P46093 362 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 SLC9A3P48764 834 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 CDH11P55287 796 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 SMIM11AP58511 58 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 TUBA1BP68363 451 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 TUBA4AP68366 448 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 RUNX1T1Q06455 604 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 SPOCK1Q08629 439 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 FHL1Q13642 323 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 LAPTM4AQ15012 233 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 HIST3H3Q16695 136 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 ANKDD1AQ495B1 522 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 ALG10Q5BKT4 473 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 FGD3Q5JSP0 725 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 ARMC4Q5T2S8 1044 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 LRFN4Q6PJG9 635 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 CYP2R1Q6VVX0 501 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 TUBA1AQ71U36 451 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 ZNF627Q7L945 461 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 HDDC2Q7Z4H3 204 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 OAFQ86UD1 273 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 CCDC36Q8IYA8 594 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 DEPDC4Q8N2C3 294 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 OR13C2Q8NGS9 318 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 OR52J3Q8NH60 311 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 OR51A7Q8NH64 312 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 ASB10Q8WXI3 467 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 SEPHS2Q99611 448 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 TXNIPQ9H3M7 391 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 MUC13Q9H3R2 512 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 IL1RAPQ9NPH3 570 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 TAS2R1Q9NYW7 299 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 LAMP3Q9UQV4 416 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 TMEM5Q9Y2B1 443 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 POFUT2Q9Y2G5 429 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 TRAV27A0A087WT01 109 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 CDC42EP2O14613 210 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 PDE5AO76074 875 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 IGKV3-15P01624 115 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 IGLV1-44P01699 117 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 FABP3P05413 133 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 DANCRP0C864 163 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 ACADSP16219 412 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 CLRN1P58418 232 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 SEC23BQ15437 767 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 TAF11Q15544 211 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 C3orf36Q3SXR2 165 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 MTX3Q5HYI7 312 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 LCN8Q6JVE9 175 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 ZNF813Q6ZN06 617 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 DHFR2Q86XF0 187 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 LRRC75AQ8NAA5 344 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 SYT14Q8NB59 555 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 NOXO1Q8NFA2 376 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 OR4K5Q8NGD3 323 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 TMEM171Q8WVE6 324 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 SLC38A2Q96QD8 506 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 ZNF347Q96SE7 839 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 FOXB1Q99853 325 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 FUZQ9BT04 418 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 CXorf56Q9H5V9 222 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 FAIMQ9NVQ4 179 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 POU2F3Q9UKI9 436 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 TLN2Q9Y4G6 2542 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 NF1P21359 2839 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa8.47□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 TCRBV5S2A0A599 114 aa8.47□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 SH3PXD2BA1X283 911 aa8.47□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa8.47□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 E7EQL1 145 aa8.47□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa8.47□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 DHHO43323 396 aa8.47□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 TRMUO75648 421 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 UBOX5O94941 541 aa8.47□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 GADD45GO95257 159 aa8.47□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 IGHMP01871 453 aa8.47□□□□□ -1.05
SRRT-208ENST00000469602 HLA-HP01893 362 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms