RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468747.5

FAM107B-211, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM107B, Length 2,633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM107B-211ENST00000468747 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
FAM107B-211ENST00000468747 NSMAFQ92636 917 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM107B-211ENST00000468747 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
FAM107B-211ENST00000468747 SLC38A3Q99624 504 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM107B-211ENST00000468747 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM107B-211ENST00000468747 MFFQ9GZY8 342 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM107B-211ENST00000468747 MTFP1Q9UDX5 166 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM107B-211ENST00000468747 CBX7O95931 251 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM107B-211ENST00000468747 RBM34P42696 430 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
FAM107B-211ENST00000468747 Q499Y3 187 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM107B-211ENST00000468747 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM107B-211ENST00000468747 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
FAM107B-211ENST00000468747 CPNE7Q9UBL6 633 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM107B-211ENST00000468747 VCANP13611 3396 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM107B-211ENST00000468747 FAM74A7A6NL05 159 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM107B-211ENST00000468747 NDUFA2O43678 99 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM107B-211ENST00000468747 MPGP29372 298 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM107B-211ENST00000468747 HYAL4Q2M3T9 481 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM107B-211ENST00000468747 FAM74A3Q4VXF1 159 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM107B-211ENST00000468747 TSSK4Q6SA08 328 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM107B-211ENST00000468747 SMRP1Q8NCR6 262 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM107B-211ENST00000468747 OR51A4Q8NGJ6 313 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM107B-211ENST00000468747 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM107B-211ENST00000468747 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
FAM107B-211ENST00000468747 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 SHISA7A6NL88 538 aa20.33■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 UPK3AO75631 287 aa20.33■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 PPP1CAP62136 330 aa20.33■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 LIPNQ5VXI9 398 aa20.33■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 C11orf88Q6PI97 169 aa20.33■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 CAMKVQ8NCB2 501 aa20.33■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 ST8SIA2Q92186 375 aa20.33■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 ALG12Q9BV10 488 aa20.33■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 ALPK2Q86TB3 2170 aa20.33■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 A0A087WV62 115 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 IGHV4-34P06331 123 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 ACHEP22303 614 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 MNDAP41218 407 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 OR10Z1Q8NGY1 313 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 OR8S1Q8NH09 359 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 OR5AK2Q8NH90 309 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 TRIM2Q9C040 744 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 FBXL21Q9UKT6 434 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 MMP17Q9ULZ9 603 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 CACNA1CQ13936 2221 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 C2CD4DB7Z1M9 353 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 TNFP01375 233 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 RPS27P42677 84 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 LEG1Q6P5S2 330 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 OR52R1Q8NGF1 315 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 HRASLS2Q9NWW9 162 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 BRWD1Q9NSI6 2320 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 URADA6NGE7 173 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 XRCC3O43542 346 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 ABHD13Q7L211 337 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 GPBAR1Q8TDU6 330 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 DUSP19Q8WTR2 217 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 ULBP3Q9BZM4 244 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 SLITRK2Q9H156 845 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 RXFP3Q9NSD7 469 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 ETV7Q9Y603 341 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 FNTBP49356 437 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 PSG6Q00889 435 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 CCINQ13939 588 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 C4orf46Q504U0 113 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 ULK3Q6PHR2 472 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 OR51D1Q8NGF3 324 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 OR6K3Q8NGY3 331 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 SLC37A2Q8TED4 501 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 LRFN5Q96NI6 719 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 NPAS1Q99742 590 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 ZNF416Q9BWM5 594 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 STARD5Q9NSY2 213 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa20.3■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 HCRTR1O43613 425 aa20.3■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 SNAPC5O75971 98 aa20.3■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 GLCEO94923 617 aa20.3■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 GPR75O95800 540 aa20.3■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 GTF2F2P13984 249 aa20.3■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 OR6N1Q8NGY5 312 aa20.3■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 SLC25A28Q96A46 364 aa20.3■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 FANCMQ8IYD8 2048 aa20.3■□□□□ 0.84
FAM107B-211ENST00000468747 C2orf74A8MZ97 194 aa20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms