RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467308.1

TSSC4-208, Transcript of tumor suppressing subtransferable candidate 4, human

TSL 3

Gene TSSC4, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSSC4-208	ENST00000467308	ST8SIA1	Q92185	356 aa		13.77	□□□□□ -0.21
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TSSC4-208	ENST00000467308	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	MPP4	Q96JB8	637 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	MUS81	Q96NY9	551 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	C12orf10	Q9HB07	376 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		13.77	□□□□□ -0.21
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TSSC4-208	ENST00000467308	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		13.77	□□□□□ -0.21
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TSSC4-208	ENST00000467308		A0A1B0GX12	115 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308		G3V2T6	193 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308		H0YJX3	145 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	SULT2B1	O00204	365 aa		13.76	□□□□□ -0.21
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TSSC4-208	ENST00000467308	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	CCR4	P51679	360 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	CDH12	P55289	794 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	SESN3	P58005	492 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	COPZ1	P61923	177 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	HOXC5	Q00444	222 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	TRAM2	Q15035	370 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	SYT14P1	Q58G82	188 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	FAM166A	Q6J272	317 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	ULK3	Q6PHR2	472 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	TMEM234	Q8WY98	164 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	EME1	Q96AY2	570 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	ADAM19	Q9H013	955 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	MALT1	Q9UDY8	824 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
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TSSC4-208	ENST00000467308		A0A1B0GWA3	101 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF716	A6NP11	495 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	VWC2L	B2RUY7	222 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308		M0R1B8	84 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	NDUFS8	O00217	210 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	GPR171	O14626	319 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	CHP2	O43745	196 aa		13.75	□□□□□ -0.21
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TSSC4-208	ENST00000467308	VHL	P40337	213 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
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TSSC4-208	ENST00000467308	USE1	Q9NZ43	259 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		13.75	□□□□□ -0.21
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TSSC4-208	ENST00000467308	PNMT	P11086	282 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	HNF1A	P20823	631 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	HTR3A	P46098	478 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
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TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	FAHD1	Q6P587	224 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	GIPC3	Q8TF64	312 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
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TSSC4-208	ENST00000467308	C3orf49	Q96BT1	292 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	PRR14	Q9BWN1	585 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	VCX	Q9H320	206 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		13.73	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms