RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

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Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 SLC8A1P32418 973 aa-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 TNFSF8P32971 234 aa-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 DEKP35659 375 aaKnown RBP-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 KRT20P35900 424 aa-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 ETFBP38117 255 aa-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 ELK3P41970 407 aa-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 CASP2P42575 452 aa-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 GLP1RP43220 463 aa-2.41□□□□□ -2.8
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SNORD54-201ENST00000459159 ARL4DP49703 201 aa-2.41□□□□□ -2.8
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SNORD54-201ENST00000459159 ZNF85Q03923 595 aa-2.41□□□□□ -2.8
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SNORD54-201ENST00000459159 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa-2.41□□□□□ -2.8
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SNORD54-201ENST00000459159 TEAD4Q15561 434 aa-2.41□□□□□ -2.8
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SNORD54-201ENST00000459159 TMEM95Q3KNT9 176 aa-2.41□□□□□ -2.8
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SNORD54-201ENST00000459159 TMEM41BQ5BJD5 291 aa-2.41□□□□□ -2.8
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SNORD54-201ENST00000459159 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa-2.41□□□□□ -2.8
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SNORD54-201ENST00000459159 CEP57Q86XR8 500 aa-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP-2.41□□□□□ -2.8
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SNORD54-201ENST00000459159 OR11H2Q8NH07 326 aa-2.41□□□□□ -2.8
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SNORD54-201ENST00000459159 SLC38A5Q8WUX1 472 aa-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 RFKQ969G6 155 aa-2.41□□□□□ -2.8
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SNORD54-201ENST00000459159 RARRES2Q99969 163 aa-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 SLC46A2Q9BY10 475 aa-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 DNAI2Q9GZS0 605 aa-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 CPVLQ9H3G5 476 aa-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 DEF6Q9H4E7 631 aa-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM165Q9HC07 324 aa-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 SLC2A9Q9NRM0 540 aa-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 MRGBPQ9NV56 204 aa-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 SLC52A1Q9NWF4 448 aa-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 C2orf42Q9NWW7 574 aa-2.41□□□□□ -2.8
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SNORD54-201ENST00000459159 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 KLHL13Q9P2N7 655 aa-2.41□□□□□ -2.8
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SNORD54-201ENST00000459159 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 WDR37Q9Y2I8 494 aa-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 IRAK3Q9Y616 596 aa-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM94Q12767 1356 aa-2.41□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 KIF15Q9NS87 1388 aa-2.41□□□□□ -2.8
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SNORD54-201ENST00000459159 A0A0G2JMP0 313 aa-2.42□□□□□ -2.8
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SNORD54-201ENST00000459159 RAB19A4D1S5 217 aa-2.42□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 OR2W5A6NFC9 320 aa-2.42□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 CD300LBA8K4G0 201 aa-2.42□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 PP2D1A8MPX8 630 aa-2.42□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 GABRR3A8MPY1 467 aa-2.42□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 AIPO00170 330 aa-2.42□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 HIP1O00291 1037 aa-2.42□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP-2.42□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 AKR7A2O43488 359 aa-2.42□□□□□ -2.8
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