RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRORSD1PA6NEY8 169 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM157AC9JC47 383 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 C11orf98E9PRG8 122 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 SYNGR3O43761 229 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 FMO6PO60774 539 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 RP2O75695 350 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 SERPINI2O75830 405 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 MT-ATP6P00846 226 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 ASAH2BP0C7U1 165 aa7.25□□□□□ -1.25
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GAPDHP28-201ENST00000455134 PGA3P0DJD8 388 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADORA3P0DMS8 318 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 IFNGR1P15260 489 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC6A2P23975 617 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 COL8A2P25067 703 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 ALDH3B1P43353 468 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 CAPZA2P47755 286 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 EVX1P49640 407 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 BIDP55957 195 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 NCALDP61601 193 aa7.25□□□□□ -1.25
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GAPDHP28-201ENST00000455134 IL1RL1Q01638 556 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 PMS2P3Q13401 168 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAB39AQ14964 217 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIST3H3Q16695 136 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 IQCCQ4KMZ1 466 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM255AQ5JRV8 349 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC35D2Q76EJ3 337 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 IL17RDQ8NFM7 739 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 SNX18Q96RF0 628 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 SEPHS2Q99611 448 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 EPYCQ99645 322 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 CGREF1Q99674 301 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 SYT3Q9BQG1 590 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 ASPNQ9BXN1 380 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 ULBP2Q9BZM5 246 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM38BQ9NVV0 291 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANGPT4Q9Y264 503 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 CMAHPQ9Y471 501 aa7.25□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa7.24□□□□□ -1.25
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GAPDHP28-201ENST00000455134 M0R233 179 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 FXYD1O00168 92 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBP2O00757 339 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 SERPINB7O75635 380 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 CH25HO95992 272 aa7.24□□□□□ -1.25
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GAPDHP28-201ENST00000455134 TSPAN19P0C672 248 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 CD79AP11912 226 aa7.24□□□□□ -1.25
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GAPDHP28-201ENST00000455134 FUT4P22083 530 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 AHCYP23526 432 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 APEX1P27695 318 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCGF2P35227 344 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 CSNK1A1P48729 337 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHN2P52757 468 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 UGT2B15P54855 530 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 ERVS71-1P61550 626 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 RUNX1T1Q06455 604 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBBP4Q09028 425 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCNIQ14094 377 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC80Q76M96 950 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
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GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC22A24Q8N4F4 322 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 C11orf65Q8NCR3 313 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF540Q8NDQ6 660 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR6N1Q8NGY5 312 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR6X1Q8NH79 312 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLDND2Q8NHS1 167 aa7.24□□□□□ -1.25
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GAPDHP28-201ENST00000455134 RNF217Q8TC41 542 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 HPS1Q92902 700 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 TSPAN32Q96QS1 320 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF607Q96SK3 696 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 EVA1AQ9H8M9 152 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 DYNLRB1Q9NP97 96 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 GLTPQ9NZD2 209 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 FZR1Q9UM11 496 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 CORO2BQ9UQ03 480 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 POFUT2Q9Y2G5 429 aa7.24□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa7.23□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAPPC13A5PLN9 417 aa7.23□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF726A6NNF4 738 aa7.23□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
GAPDHP28-201ENST00000455134 DHHO43323 396 aa7.23□□□□□ -1.25
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