RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	LINGO2	Q7L985	606 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	WDR31	Q8NA23	367 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	OR2T29	Q8NH02	315 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	NINJ1	Q92982	152 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	RADIL	Q96JH8	1075 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	ALG12	Q9BV10	488 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	EMC6	Q9BV81	110 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	POLQ	O75417	2590 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	TACC2	O95359	2948 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241		M0R3G1	203 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	TNFRSF11B	O00300	401 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	EBAG9	O00559	213 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	SERPINI2	O75830	405 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFB2	O95178	105 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	CD14	P08571	375 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	ACADS	P16219	412 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	PTAFR	P25105	342 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	CLRN1	P58418	232 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	LGALS3BP	Q08380	585 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	LAPTM4A	Q15012	233 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	ASRGL1	Q7L266	308 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	OR51A7	Q8NH64	312 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	CHID1	Q9BWS9	393 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	REEP1	Q9H902	201 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	CREBBP	Q92793	2442 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	UNC119B	A6NIH7	251 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	OR10H3	O60404	316 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	TMCC2	O75069	709 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	CD3E	P07766	207 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	GSS	P48637	474 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP10-9	P60411	292 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	CTXN1	P60606	82 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	TSPAN31	Q12999	210 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	MELK	Q14680	651 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	C10orf128	Q5T292	105 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	CARD17	Q5XLA6	110 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	OR52N5	Q8NH56	324 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF519	Q8TB69	540 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	KCNK17	Q96T54	332 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	FOXB1	Q99853	325 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	NELFA	Q9H3P2	528 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	DSCAM	O60469	2012 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	DHH	O43323	396 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	CCNB2	O95067	398 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	CST1	P01037	141 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	MICA	Q29983	383 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	THEM4	Q5T1C6	240 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		12.8	□□□□□ -0.36

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