RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 CORO2BQ9UQ03 480 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 A0A0A6YYJ9 748 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 AIREO43918 545 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 SSX5O60225 188 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 PTP4A3O75365 173 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 SERPINI2O75830 405 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 LY6G6DO95868 133 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 QDPRP09417 244 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
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PTPRR-204ENST00000440835 MPIP34949 423 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 PRIM2P49643 509 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 KCNJ10P78508 379 aa5.39□□□□□ -1.55
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PTPRR-204ENST00000440835 ZNF763Q0D2J5 394 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 FAM209BQ5JX69 171 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 PDSS1Q5T2R2 415 aa5.39□□□□□ -1.55
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PTPRR-204ENST00000440835 NGBQ9NPG2 151 aa5.39□□□□□ -1.55
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PTPRR-204ENST00000440835 EMC9Q9Y3B6 208 aa5.39□□□□□ -1.55
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PTPRR-204ENST00000440835 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa5.38□□□□□ -1.55
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PTPRR-204ENST00000440835 M0R082 166 aa5.38□□□□□ -1.55
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PTPRR-204ENST00000440835 SNAPINO95295 136 aa5.38□□□□□ -1.55
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PTPRR-204ENST00000440835 CGAP01215 116 aa5.38□□□□□ -1.55
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PTPRR-204ENST00000440835 UMPSP11172 480 aa5.38□□□□□ -1.55
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PTPRR-204ENST00000440835 B3GALT5-AS1P59052 145 aa5.38□□□□□ -1.55
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PTPRR-204ENST00000440835 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 DECR1Q16698 335 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM44Q2T9K0 475 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 SPANXN2Q5MJ10 180 aa5.38□□□□□ -1.55
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PTPRR-204ENST00000440835 COMMD7Q86VX2 200 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 MISPQ8IVT2 679 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 FAM86B1Q8N7N1 296 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF611Q8N823 705 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 OR52R1Q8NGF1 315 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 CLHC1Q8NHS4 586 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM171Q8WVE6 324 aa5.38□□□□□ -1.55
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PTPRR-204ENST00000440835 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 TSSK3Q96PN8 268 aa5.38□□□□□ -1.55
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PTPRR-204ENST00000440835 G6PC3Q9BUM1 346 aa5.38□□□□□ -1.55
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PTPRR-204ENST00000440835 NIPAL2Q9H841 368 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 MYNNQ9NPC7 610 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 SLC52A3Q9NQ40 469 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 SLAMF8Q9P0V8 285 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 IL19Q9UHD0 177 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 U3KQV3 271 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRR-204ENST00000440835 MED12LQ86YW9 2145 aa5.38□□□□□ -1.55
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