RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433358.5

NME4-204, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 3

Gene NME4, Length 966 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-204ENST00000433358 PDLIM4P50479 330 aa20.15■□□□□ 0.82
NME4-204ENST00000433358 TAS2R41P59536 307 aa20.15■□□□□ 0.82
NME4-204ENST00000433358 RAB1AP62820 205 aa20.15■□□□□ 0.82
NME4-204ENST00000433358 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
NME4-204ENST00000433358 MELKQ14680 651 aa20.15■□□□□ 0.82
NME4-204ENST00000433358 DEF8Q6ZN54 512 aa20.15■□□□□ 0.82
NME4-204ENST00000433358 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
NME4-204ENST00000433358 SKA3Q8IX90 412 aa20.15■□□□□ 0.82
NME4-204ENST00000433358 ZNF566Q969W8 418 aa20.15■□□□□ 0.82
NME4-204ENST00000433358 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
NME4-204ENST00000433358 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
NME4-204ENST00000433358 CAPN7Q9Y6W3 813 aa20.15■□□□□ 0.82
NME4-204ENST00000433358 A8MV72 311 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 FAM220BPB1ANY3 271 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 hCG_2039718K7EN88 272 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 OR5F1O95221 314 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 ZNF35P13682 527 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 FUT1P19526 365 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 USF1P22415 310 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 NR4A1P22736 598 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 RBM34P42696 430 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 PPOXP50336 477 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 UGT2B15P54855 530 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 VLDLRP98155 873 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 DAG1Q14118 895 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 CYBRD1Q53TN4 286 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 KRT80Q6KB66 452 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 SPATA21Q7Z572 469 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 HIPK1Q86Z02 1210 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 SVOPLQ8N434 492 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 PFN4Q8NHR9 129 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 TMEM255BQ8WV15 326 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 ARMCX1Q9P291 453 aa20.14■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 SLC22A2O15244 555 aa20.13■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 BCL10O95999 233 aa20.13■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 PATE4P0C8F1 98 aa20.13■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 GIPRP48546 466 aa20.13■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa20.13■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 OR2T12Q8NG77 320 aa20.13■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 FGFBP3Q8TAT2 258 aa20.13■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 TMEM239Q8WW34 195 aa20.13■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 RCN3Q96D15 328 aa20.13■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 FOXN4Q96NZ1 517 aa20.13■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 ELOVL7A1L3X0 281 aa20.12■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 NDUFS8O00217 210 aa20.12■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 DHHO43323 396 aa20.12■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 OR7A10O76100 309 aa20.12■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 UBL3O95164 117 aa20.12■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 IGF2P01344 180 aa20.12■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 F13BP05160 661 aa20.12■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 PGA4P0DJD7 388 aa20.12■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 PGA3P0DJD8 388 aa20.12■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 SELENOWP63302 87 aa20.12■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.815e-7■■■■□ 25.3
NME4-204ENST00000433358 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 C6orf52Q5T4I8 152 aa20.12■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 MICU2Q8IYU8 434 aa20.12■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 SLC22A24Q8N4F4 322 aa20.12■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 POU5F2Q8N7G0 328 aa20.12■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 SGTBQ96EQ0 304 aa20.12■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 MDFIQ99750 246 aa20.12■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 RAB1BQ9H0U4 201 aa20.12■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 C20orf141Q9NUB4 165 aa20.12■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 CMTM6Q9NX76 183 aa20.12■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 CMAHPQ9Y471 501 aa20.12■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa20.11■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 SH3PXD2BA1X283 911 aa20.11■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 RAB36O95755 333 aa20.11■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 QDPRP09417 244 aa20.11■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 THRBP10828 461 aa20.11■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 MDH1P40925 334 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 NR4A2P43354 598 aa20.11■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 RUNX1T1Q06455 604 aa20.11■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 RAB39AQ14964 217 aa20.11■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 HIST3H3Q16695 136 aa20.11■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 MSMPQ1L6U9 139 aa20.11■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 HSP90B2PQ58FF3 399 aa20.11■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 LIPHQ8WWY8 451 aa20.11■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 TPD52L3Q96J77 140 aa20.11■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 TMEM38BQ9NVV0 291 aa20.11■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 TSPAN19P0C672 248 aa20.1■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 OR8G3PP0DMU2 310 aa20.1■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 IGHV4-31P0DP07 118 aa20.1■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 AQP2P41181 271 aa20.1■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 CARTPTQ16568 116 aa20.1■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 CYB5R2Q6BCY4 276 aa20.1■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 SLC15A3Q8IY34 581 aa20.1■□□□□ 0.81
NME4-204ENST00000433358 MCHR2Q969V1 340 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms