RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 ZNF229Q9UJW7 825 aa23.52■■□□□ 1.36
LMO1-202ENST00000428101 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
LMO1-202ENST00000428101 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa23.51■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 RNF13O43567 381 aa23.51■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 COQ5Q5HYK3 327 aa23.51■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 CGB2Q6NT52 195 aa23.51■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 LRFN4Q6PJG9 635 aa23.51■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 CDK20Q8IZL9 346 aa23.51■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 KCNK17Q96T54 332 aa23.51■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 SH3GL1Q99961 368 aa23.51■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 MXRA5Q9NR99 2828 aa23.5■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 TNFRSF1BP20333 461 aa23.5■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 GIPRP48546 466 aa23.5■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 RAB1AP62820 205 aa23.5■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 KLF10Q13118 480 aa23.5■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 MELKQ14680 651 aa23.5■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 REP15Q6BDI9 236 aa23.5■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 PODNL1Q6PEZ8 512 aa23.5■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 CARM1Q86X55 608 aa23.5■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 FGFBP3Q8TAT2 258 aa23.5■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 ZNF583Q96ND8 569 aa23.5■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 ECSITQ9BQ95 431 aa23.5■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 SAR1AQ9NR31 198 aa23.5■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa23.5■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa23.5■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 SH3GLB1Q9Y371 365 aa23.5■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 SH3PXD2BA1X283 911 aa23.49■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 NPPAP01160 153 aa23.49■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 ARFIP2P53365 341 aa23.49■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 SKA3Q8IX90 412 aa23.49■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 ZNF566Q969W8 418 aa23.49■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 BPESC1Q9GZL8 116 aa23.49■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 CMAHPQ9Y471 501 aa23.49■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 MRASO14807 208 aa23.48■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 UBL3O95164 117 aa23.48■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 STAMBPO95630 424 aa23.48■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 IFNA2P01563 188 aa23.48■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 HIST1H2ABP04908 130 aa23.48■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 PATE4P0C8F1 98 aa23.48■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 PGA4P0DJD7 388 aa23.48■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 PGA3P0DJD8 388 aa23.48■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 GZMKP49863 264 aa23.48■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 MMEL1Q495T6 779 aa23.48■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa23.48■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 NKAIN4Q8IVV8 208 aa23.48■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 HIST1H2ACQ93077 130 aa23.48■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 MRGBPQ9NV56 204 aa23.48■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 BBIP1A8MTZ0 92 aa23.47■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 RAB36O95755 333 aa23.47■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 FAM157CP0CG43 387 aa23.47■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 UMPSP11172 480 aa23.47■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 DAOP14920 347 aa23.47■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 UGT2B15P54855 530 aa23.47■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 RAB39AQ14964 217 aa23.47■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 ZNF584Q8IVC4 421 aa23.47■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 SLC22A24Q8N4F4 322 aa23.47■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 PFN4Q8NHR9 129 aa23.47■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 SPATA3Q8NHX4 192 aa23.47■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 C10orf82Q8WW14 230 aa23.47■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 BAG5Q9UL15 447 aa23.47■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa23.46■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 LMX1BO60663 402 aa23.46■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 MT-ND1P03886 318 aa23.46■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 ADRA2AP08913 450 aa23.46■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 APEHP13798 732 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 GIFP27352 417 aa23.46■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 GLRXP35754 106 aa23.46■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 EVX1P49640 407 aa23.46■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 FXNQ16595 210 aa23.46■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 IQCCQ4KMZ1 466 aa23.46■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 ERICH5Q6P6B1 374 aa23.46■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa23.46■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa23.46■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 ZNF540Q8NDQ6 660 aa23.46■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 TMEM255BQ8WV15 326 aa23.46■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 DYNLRB1Q9NP97 96 aa23.46■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 C20orf141Q9NUB4 165 aa23.46■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 TMEM38BQ9NVV0 291 aa23.46■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 RIMS3Q9UJD0 308 aa23.46■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 SPEF1Q9Y4P9 236 aa23.46■■□□□ 1.35
LMO1-202ENST00000428101 LOC100653049A0A140TA62 436 aa23.45■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 DHHO43323 396 aa23.45■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 KRT34O76011 436 aa23.45■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 BCL10O95999 233 aa23.45■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 QDPRP09417 244 aa23.45■■□□□ 1.34
LMO1-202ENST00000428101 OR8G3PP0DMU2 310 aa23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms