RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0B4J2E0 115 aa11.27□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GX12 115 aa11.27□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM89A2RUT3 159 aa11.27□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF726A6NNF4 738 aa11.27□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM77I1YAP6 450 aa11.27□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPHA1P21709 976 aa11.27□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSNK1A1P48729 337 aa11.27□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PMS2P3Q13401 168 aa11.27□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB39AQ14964 217 aa11.27□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa11.27□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC2A7Q6PXP3 512 aa11.27□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NHLRC1Q6VVB1 395 aa11.27□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF584Q8IVC4 421 aa11.27□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TEX29Q8N6K0 151 aa11.27□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa11.27□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C3orf56Q8N813 242 aa11.27□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NFKBIDQ8NI38 313 aa11.27□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF217Q8TC41 542 aa11.27□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAHD2AQ96GK7 314 aa11.27□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MOGAT1Q96PD6 335 aa11.27□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 G6PC2Q9NQR9 355 aa11.27□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa11.27□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LOC105371242A0A075B767 164 aa11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRN3E7EW58 273 aa11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBDO15205 165 aa11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERPINI2O75830 405 aa11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARAFP10398 606 aa11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EGR1P18146 543 aa11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AHCYP23526 432 aa11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAGEB1P43366 347 aa11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARFIP2P53365 341 aa11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR4P57081 412 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYBPC1Q00872 1141 aa11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NKPD1Q17RQ9 610 aa11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALKBH6Q3KRA9 238 aa11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEP85LQ5SZL2 805 aa11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GCNT6Q5T4J0 391 aa11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAVSQ7Z434 540 aa11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PXKQ7Z7A4 578 aa11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT73Q86Y46 540 aa11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MIER2Q8N344 545 aa11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SGMS2Q8NHU3 365 aa11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF665Q9H7R5 613 aa11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM27Q9HBJ8 222 aa11.26□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C17orf100A8MU93 164 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLPP3O14495 311 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPST1O60507 370 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERPINA5P05154 406 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PATE4P0C8F1 98 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BIDP55957 195 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR1Q1Q15612 314 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 REEP3Q6NUK4 255 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CROCCP2Q86T23 111 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SKA3Q8IX90 412 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C10orf111Q8N326 155 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C10orf53Q8N6V4 93 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGFBP3Q8TAT2 258 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR52B2Q96RD2 323 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 JMJD8Q96S16 334 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM43Q9BTV4 400 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAAR3PQ9P1P4 343 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MGAM2Q2M2H8 2515 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0G2JMP0 313 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0X1KG70 313 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC22A23A1A5C7 686 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDC14BO60729 498 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLPTM1O96005 669 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AVPP01185 164 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM157BP0CG42 384 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANPEPP15144 967 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LIMS1P48059 325 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDH12P55289 794 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDK6Q00534 326 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MMEL1Q495T6 779 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRIF1Q5T3J3 769 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AVPI1Q5T686 147 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACSM5Q6NUN0 579 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1QL2Q7Z5L3 287 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MSRB3Q8IXL7 192 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC22A24Q8N4F4 322 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC30A7Q8NEW0 376 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR4M2Q8NGB6 313 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR5J2Q8NH18 312 aa11.25□□□□□ -0.61
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNX33Q8WV41 574 aa11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms