RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417339.2

CENPVL3-201, Transcript of centromere protein V like 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CENPVL3, Length 864 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPVL3-201ENST00000417339 FZR1Q9UM11 496 aa18.49■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 STAB1Q9NY15 2570 aa18.48■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 SASH3O75995 380 aa18.48■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 MT-ATP6P00846 226 aa18.48■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 ZNF35P13682 527 aa18.48■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 RAB39AQ14964 217 aa18.48■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 RABL3Q5HYI8 236 aa18.48■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 CCDC36Q8IYA8 594 aa18.48■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa18.48■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 SHARPINQ9H0F6 387 aa18.48■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 DYNLRB1Q9NP97 96 aa18.48■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 TMEM160Q9NX00 188 aa18.48■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 TRIM33Q9UPN9 1127 aa18.48■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 TRAPPC13A5PLN9 417 aa18.47■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 OR6A2O95222 327 aa18.47■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 ZNF23P17027 643 aa18.47■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 RAB1AP62820 205 aa18.47■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 ZP4Q12836 540 aa18.47■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 VMACQ2NL98 169 aa18.47■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 NANOGP8Q6NSW7 305 aa18.47■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 LRFN4Q6PJG9 635 aa18.47■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 ZNF584Q8IVC4 421 aa18.47■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 TSPEARQ8WU66 669 aa18.47■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 SYT3Q9BQG1 590 aa18.47■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 NANOGQ9H9S0 305 aa18.47■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 GLTPQ9NZD2 209 aa18.47■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 CMAHPQ9Y471 501 aa18.47■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 FXYD1O00168 92 aa18.46■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 RNF13O43567 381 aa18.46■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 LILRA1O75019 489 aa18.46■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 SEC24CP53992 1094 aa18.46■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 RUNX1T1Q06455 604 aa18.46■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 TRIP10Q15642 601 aa18.46■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 FAM166AQ6J272 317 aa18.46■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 CALHM3Q86XJ0 350 aa18.46■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 NKAIN4Q8IVV8 208 aa18.46■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 IL17RDQ8NFM7 739 aa18.46■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 OR6X1Q8NH79 312 aa18.46■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 PFN4Q8NHR9 129 aa18.46■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 SLC26A7Q8TE54 656 aa18.46■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 SH3GL3Q99963 347 aa18.46■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 ZNF426Q9BUY5 554 aa18.46■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 NANSQ9NR45 359 aa18.46■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 KCNS2Q9ULS6 477 aa18.46■□□□□ 0.55
CENPVL3-201ENST00000417339 VSTM5A8MXK1 200 aa18.45■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 TGFAP01135 160 aa18.45■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 ASAH2BP0C7U1 165 aa18.45■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 UMPSP11172 480 aa18.45■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 GIFP27352 417 aa18.45■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 ALDH3B1P43353 468 aa18.45■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 UGT2B15P54855 530 aa18.45■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 MYBPC1Q00872 1141 aa18.45■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 FAM120AOSQ5T036 256 aa18.45■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 CCDC80Q76M96 950 aa18.45■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 CARM1Q86X55 608 aa18.45■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 UBASH3BQ8TF42 649 aa18.45■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 PCDHAC1Q9H158 963 aa18.45■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 RAB36O95755 333 aa18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 CCL2P13500 99 aa18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 FXNQ16595 210 aa18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 CGB2Q6NT52 195 aa18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 SLC30A8Q8IWU4 369 aa18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 ZNF786Q8N393 782 aa18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 SLC22A24Q8N4F4 322 aa18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 LRRC58Q96CX6 371 aa18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 SNX18Q96RF0 628 aa18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 ZNF347Q96SE7 839 aa18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 VIPAS39Q9H9C1 493 aa18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 TMEM38BQ9NVV0 291 aa18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 LPAR3Q9UBY5 353 aa18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 SH3GLB1Q9Y371 365 aa18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa18.43■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 DHHO43323 396 aa18.43■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 F13BP05160 661 aa18.43■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 QDPRP09417 244 aa18.43■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 PGA4P0DJD7 388 aa18.43■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 PGA3P0DJD8 388 aa18.43■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 FUT4P22083 530 aa18.43■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 GLRXP35754 106 aa18.43■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa18.43■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 REP15Q6BDI9 236 aa18.43■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 DEF8Q6ZN54 512 aa18.43■□□□□ 0.54
CENPVL3-201ENST00000417339 TMEM255BQ8WV15 326 aa18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms