RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 FOLR3P41439 243 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 GDI2P50395 445 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RAB15P59190 212 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RPL27P61353 136 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 NTRK2Q16620 822 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF181Q2M3W8 571 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CDONQ4KMG0 1287 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 DDI2Q5TDH0 399 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM131AQ6UXB0 335 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 DPY19L4Q7Z388 723 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SYS1Q8N2H4 156 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 MS4A15Q8N5U1 240 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 EXD3Q8N9H8 876 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 OR11G2Q8NGC1 345 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 OR4K17Q8NGC6 315 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 THEM6Q8WUY1 208 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 HTRA1Q92743 480 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PGLYRP3Q96LB9 341 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 IMMP1LQ96LU5 166 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 C5orf34Q96MH7 638 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CDCP1Q9H5V8 836 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 WDR76Q9H967 626 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF160Q9HCG1 818 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 FBXL2Q9UKC9 423 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 IKZF2Q9UKS7 526 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 WIF1Q9Y5W5 379 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 MED12Q93074 2177 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PRSS37A4D1T9 235 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PRR32B1ATL7 298 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 B4E171 279 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 G3V3Y1 287 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TP53I11O14683 189 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 OGG1O15527 345 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 EFNA2O43921 213 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC16A7O60669 478 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 HPGDSO60760 199 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 AKR7A3O95154 331 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 OR8G3PP0DMU2 310 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 GALP22466 123 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 MYL9P24844 172 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TSPAN7P41732 249 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TLE3Q04726 772 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CDK5R1Q15078 307 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAM1Q15629 374 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ETFDHQ16134 617 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 EXT1Q16394 746 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 IDNKQ5T6J7 187 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 C5orf46Q6UWT4 87 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC16A9Q7RTY1 509 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SYT9Q86SS6 491 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TIGD4Q8IY51 512 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM156Q8N614 296 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 YIPF7Q8N8F6 280 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 DDIT4LQ96D03 193 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 STRADBQ9C0K7 418 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF32Q9H0A6 362 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF700Q9H0M5 742 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TXNIPQ9H3M7 391 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 C12orf49Q9H741 205 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 MALT1Q9UDY8 824 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 LAMP5Q9UJQ1 280 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 B9D1Q9UPM9 204 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CACNA1HO95180 2353 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 FUOMA2VDF0 154 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ISPDA4D126 451 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 FTCDNL1E5RQL4 147 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 MS4A18H0YCH9 400 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TMCC2O75069 709 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 DLGAP3O95886 979 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CYC1P08574 325 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 IMPDH2P12268 514 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CD59P13987 128 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CD53P19397 219 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SFTPDP35247 375 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 MAGEB1P43366 347 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CAPZA2P47755 286 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 MTNR1BP49286 362 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 OR10A3P58181 314 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 HSF2Q03933 536 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PUDPQ08623 228 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF79Q15937 498 aa3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms