RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-204ENST00000400919 PAX7P23759 505 aa24.08■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 ARF1P84077 181 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 LRRC75AQ8NAA5 344 aa24.08■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 OR4C15Q8NGM1 316 aa24.08■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 GRHPRQ9UBQ7 328 aa24.08■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 CD14P08571 375 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 ERFP50548 548 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 PHYHD1Q5SRE7 291 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 IGFN1Q86VF2 1251 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 WDFY1Q8IWB7 410 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 KATNB1Q9BVA0 655 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 SLC25A15Q9Y619 301 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 A6NIZ1 184 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 FKBP6O75344 327 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 RAP1BP61224 184 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 RAP1AP62834 184 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 TSPAN31Q12999 210 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 MICAQ29983 383 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 TBRG1Q3YBR2 411 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 HIKESHIQ53FT3 197 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 PGBD2Q6P3X8 592 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 NOXO1Q8NFA2 376 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 PLPPR2Q96GM1 343 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 GPA33Q99795 319 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 ENTPD5O75356 428 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 TRMUO75648 421 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 ACVR1BP36896 505 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 SMARCD3Q6STE5 483 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 KLHL17Q6TDP4 642 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 CCDC36Q8IYA8 594 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 SYT14Q8NB59 555 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 FNDC8Q8TC99 324 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 LURAP1Q96LR2 239 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 ALPK2Q86TB3 2170 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 CACNA1DQ01668 2161 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 ABCA12Q86UK0 2595 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 A0A096LPE4 126 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 A0A1W2PPZ6 126 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 A0A1W2PR80 420 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 SIAH2O43255 324 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 QDPRP09417 244 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 GSSP48637 474 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 ERVK-25P63136 954 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 RUNX1T1Q06455 604 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 HIST3H3Q16695 136 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 CDC20BQ86Y33 519 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 WDR31Q8NA23 367 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 OR9Q2Q8NGE9 314 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 FANK1Q8TC84 345 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 RBP7Q96R05 134 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 VNN3Q9NY84 501 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 EDARQ9UNE0 448 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 XKRYO14609 159 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 E2F6O75461 281 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 CD47Q08722 323 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 GPR139Q6DWJ6 353 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 LRFN4Q6PJG9 635 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 AQP11Q8NBQ7 271 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 MCHR2Q969V1 340 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 TSPAN32Q96QS1 320 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 ALG12Q9BV10 488 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 DNAJB9Q9UBS3 223 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 DCHS2Q6V1P9 2916 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 DHHO43323 396 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF84P51523 738 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 RPS6KA3P51812 740 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 ARHGDIAP52565 204 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 KRTAP10-9P60411 292 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 RFX4Q33E94 735 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 TMEM108Q6UXF1 575 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF813Q6ZN06 617 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF627Q7L945 461 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 SLCO4A1Q96BD0 722 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF570Q96NI8 536 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 KCNK17Q96T54 332 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 FOXB1Q99853 325 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 OR52D1Q9H346 318 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 SMURF2Q9HAU4 748 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 NRIP3Q9NQ35 241 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-204ENST00000400919 MGAT4BQ9UQ53 548 aa24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms