RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376854.5

C9orf40-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf40, Length 2,327 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40-201ENST00000376854 SPICQ8N5J4 248 aa22.95■■□□□ 1.26
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C9orf40-201ENST00000376854 TMEM212A6NML5 194 aa22.93■■□□□ 1.26
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C9orf40-201ENST00000376854 SLC37A1P57057 533 aa22.93■■□□□ 1.26
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C9orf40-201ENST00000376854 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa22.93■■□□□ 1.26
C9orf40-201ENST00000376854 GPR148Q8TDV2 347 aa22.93■■□□□ 1.26
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C9orf40-201ENST00000376854 RLN3Q8WXF3 142 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf40-201ENST00000376854 ADOQ96SZ5 270 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf40-201ENST00000376854 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
C9orf40-201ENST00000376854 XRCC3O43542 346 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf40-201ENST00000376854 TPPPO94811 219 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf40-201ENST00000376854 IL5P05113 134 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf40-201ENST00000376854 DMWDQ09019 674 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf40-201ENST00000376854 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
C9orf40-201ENST00000376854 MAMSTRQ6ZN01 415 aa22.91■■□□□ 1.26
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