RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368147.8

SPTA1-201, Transcript of spectrin alpha, erythrocytic 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTA1, Length 7,999 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Dendrite .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1-201ENST00000368147 NID2Q14112 1375 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 NXPH2O95156 264 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 CRABP1P29762 137 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 IL2RGP31785 369 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 KIR2DL3P43628 341 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 CSN1S1P47710 185 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 SLC7A9P82251 487 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 OR1Q1Q15612 314 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 DUSP6Q16828 381 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 LCTLQ6UWM7 567 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 LINC00346Q8IVM7 164 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 OR8U1Q8NH10 309 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 REEP6Q96HR9 211 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 LAMB1P07942 1786 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 A0A1W2PRV1 198 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 PRAMEF4O60810 478 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 SPDEFO95238 335 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 PSMB3P49720 205 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 CTSL3PQ5NE16 218 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 NDUFAF7Q7L592 441 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 ATG101Q9BSB4 218 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 SIAEQ9HAT2 523 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 MARCH5Q9NX47 278 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 CLEC1BQ9P126 229 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 LAP3P28838 519 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 SSTR4P31391 388 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 HMGCLP35914 325 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 PSMB2P49721 201 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 RNF212Q495C1 297 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 C19orf48Q6RUI8 117 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF679Q8IYX0 411 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 TMEM18Q96B42 140 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 PRRT1Q99946 306 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 ACKR4Q9NPB9 350 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 FAM183AA6NL82 134 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 AMY2AP04746 511 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 CT45A10P0DMU9 189 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 FDXRP22570 491 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 FOXA1P55317 472 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 PRPS1P60891 318 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 NADK2Q4G0N4 442 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 CORO6Q6QEF8 472 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF561Q8N587 486 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 OR5W2Q8NH69 310 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 PAQR8Q8TEZ7 354 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 TOX2Q96NM4 488 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 RANBP9Q96S59 729 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 PIGQQ9BRB3 760 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 P2RY12Q9H244 342 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 OCEL1Q9H607 264 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 EMC7Q9NPA0 242 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 PPT2Q9UMR5 302 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 A6NIZ1 184 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 LRRC30A6NM36 301 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 GAAP10253 952 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 CD27P26842 260 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 GIPRP48546 466 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 HLCSP50747 726 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 CXCR4P61073 352 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 RAP1BP61224 184 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 RAP1AP62834 184 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 GPR50Q13585 617 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 KDM8Q8N371 416 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 SFXN5Q8TD22 340 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 AMDHD1Q96NU7 426 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 TRIB3Q96RU7 358 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 INTS14Q96SY0 518 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 SLC30A3Q99726 388 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 PTTG3PQ9NZH4 202 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa6.54□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 H0YAE9 185 aa6.54□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 SOCS6O14544 535 aa6.54□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 AIFM1O95831 613 aa6.54□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 FPR1P21462 350 aa6.54□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 AQP2P41181 271 aa6.54□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 GAB1Q13480 694 aa6.54□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF684Q5T5D7 378 aa6.54□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 CARFQ8N187 725 aa6.54□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.54□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 OR14A16Q8NHC5 309 aa6.54□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 FGF14Q92915 247 aa6.54□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.54□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.54□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 PKIBQ9C010 78 aa6.54□□□□□ -1.36
SPTA1-201ENST00000368147 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms