RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361320.4

LRRTM3-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM3, Length 4,358 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-201ENST00000361320 DTX4Q9Y2E6 619 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 FABP12A6NFH5 140 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 GATBO75879 557 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 C7P10643 843 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 MSR1P21757 451 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC2A5P22732 501 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 RPS27P42677 84 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 COL19A1Q14993 1142 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 CD226Q15762 336 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 MEP1BQ16820 701 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 C22orf42Q6IC83 251 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 ANKRD16Q6P6B7 361 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF773Q6PK81 442 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 PGAP1Q75T13 922 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 DCXRQ7Z4W1 244 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 IL17RDQ8NFM7 739 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 RAB2BQ8WUD1 216 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 LRFN5Q96NI6 719 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 SEC14L4Q9UDX3 406 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 CD300AQ9UGN4 299 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 C9orf172C9J069 976 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 WRBO00258 174 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 SOCS6O14544 535 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 LYZL6O75951 148 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 FRKP42685 505 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 MAP2K6P52564 334 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 MZT1Q08AG7 82 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 ABCA11PQ4W5N1 156 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 AWAT2Q6E213 333 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 TMEM200AQ86VY9 491 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 OR11L1Q8NGX0 322 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF226Q9NYT6 803 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 CEP350Q5VT06 3117 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 A0A087WUJ7 227 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 EFSO43281 561 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 DHHO43323 396 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 CD3GP09693 182 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 GLP1RP43220 463 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 DAPP51397 102 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 OCLNQ16625 522 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 MOGQ16653 247 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 RNF220Q5VTB9 566 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 USP43Q70EL4 1123 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 ZAR1Q86SH2 424 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 MKXQ8IYA7 352 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 PRR18Q8N4B5 295 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 FBXL2Q9UKC9 423 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 DOCK9Q9BZ29 2069 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 PATJQ8NI35 1801 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 C5orf49A4QMS7 147 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 SSNA1O43805 119 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF432O94892 652 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 MPIG6BO95866 241 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 HRGP04196 525 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 CT45A8P0DMV1 189 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 CT45A9P0DMV2 189 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 GALNSP34059 522 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF83P51522 516 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 RPS23P62266 143 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF91Q05481 1191 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 CDK5R2Q13319 367 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 E2F2Q14209 437 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 STK35Q8TDR2 534 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 HES7Q9BYE0 225 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 MOKQ9UQ07 419 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 ACOT8O14734 319 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 PEX14O75381 377 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 LY6DQ14210 128 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 NHSL2Q5HYW2 709 aa6.38□□□□□ -1.39
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM198BQ6UWH4 519 aa6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms